The SMC5/6 complex in nucleome organization
Cíle projektu
a) Characterization of activities of the SMC5/6 complexes b) Determination of the chromatin localization and dynamics of SMC5/6 c) Identification of chromatin loops dependent on SMC5/6 activities d) Development of visual models of chromatin fibres shaped by SMC complexes
Klíčová slova
Nucleomechromatin fiberschromatin loopsSMC complexesSMC5/6 complexvisualizationvisual analysismodelling
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
Program
INTER-EXCELLENCE
Veřejná soutěž
SMSM2020LTC01
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
MSMT-21080/2020-18
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The SMC5/6 complex in nucleome organization
Anotace anglicky
a) Characterization of activities of the SMC5/6 complexes b) Determination of the chromatin localization and dynamics of SMC5/6 c) Identification of chromatin loops dependent on SMC5/6 activities d) Development of visual models of chromatin fibres shaped by SMC complexes
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi
BC - Teorie a systémy řízení
BD - Teorie informace
CE - Biochemie
EB - Genetika a molekulární biologie
IN - Informatika
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu se podařilo prozkoumat aktivity komplexu SMC5/6 a jeho podíl na udržování stability chromatinového vlákna (Kolesár et al., Cells, 2022). Byl zjištěn vliv interakčních partnerů na lokalizaci SMC5/6 komplexu do specifických částí chromatinu (Mahrik et al., Epigen and Chromatin, 2023). Dále jsme navrhli a implementovali webový nástroj pro vizualizaci chromatinového vlákna. K získání výsledků přispěla mezinárodní spolupráce v rámci COST akce.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 7. 2020
Ukončení řešení
30. 4. 2023
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
17. 2. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MSM-LT-U
Datum dodání záznamu
1. 7. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
7 289 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 289 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
7 289 tis. Kč
Statní podpora
7 289 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy
OECD FORD
Biochemistry and molecular biology
Doba řešení
01. 07. 2020 - 30. 04. 2023