Domény aminokyselinové sekvence rostlinné cytokin dehydrogenázy odpovědné za substrátovou specifitu a funkční konformaci proteinu

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

Program podpory začínajících pracovníků výzkumu a vývoje (LZ)

Veřejná soutěž

Program podpory začínajících pracovníků výzkumu a vývoje (LZ) (SMSM200300001)

Hlavní účastníci

Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

UP - Popelková

Anotace anglicky

The main objective of this proposal is flavoenzyme cytokinin oxidase/dehydrogenase that catalyzes the metabolic breakdown of cytokinin hormones N6-(2-isopentenyl)adenine and zeatin, and, in this way, regulates thier metabolism in plants.This flavoenzymeis encoded by seven genes in the genome of the model plant Arabidopsis thaliana. One of these genes, AtCKX2, has been already cloned and expressed in the yeast cells Saccharomyces cerevisae 23344 as the AtCKX2 protein.The goal of this project is mutagensis of the AtCKX2 gene in order to produce mutant proteins. We want to find domains or particular residues in amino acid sequence of AtCKX2 that are essential for its substrate specificity and functional structure.The search for these sequences will be based on the molecular modeling and sequence alignment of homologous amino acid sequences of AtCKX2 and D-lactate dehydrogenase or other flavoenzymes with known functional structure.

Kategorie VaV

IF - Infrastruktura výzkumu, vývoje a inovací

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl vytvořen homologický model enzymu cytokinin oxidasa/dehydrogenasa (CKX), byly identifikovány a charakterizovány meziprodukty jeho katalytické reakce, a bylo vytvořeno 9 mutantních linií kvasinek produkujících CKX.

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-MSM-LZ-U/04:2

Datum dodání záznamu

29. 5. 2008

Celkové uznané náklady

2 004 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 376 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

628 tis. Kč