Konstrukce chromozómově specifických knihoven DNA a analýza genomu ječmene

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT

Veřejná soutěž

KONTAKT 1 (SMSM200132001)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Construction of chromosome-specific DNA libraries and genome analysis in barley

Anotace anglicky

The project is focused on the use of chromosomes sorted using flow cytometry for efficient analysis of barley genome. DNA prepared from chromosome 5 will be used for construction of large-insert DNA libraries cloned in a BAC vector. In addition to the construction of chromosome-specific BAC libraries, a method for isolation of gene-rich chromosome-specific DNA will be optimised. The DNA will be used for isolation of molecular markers, which will serve to increase the density of genetic linkage map. DNAchips will be prepared using a robotic workstation and used to select BAC clones containing molecular markers tightly linked to agriculturally important traits. Moreover, BAC clones rich in coding sequences will be selected, subcloned and sequenced. Their structure will be analysed in detail. This study will lead to better understanding the structure of gene-rich genome regions and to discovery of new genes in barley.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V průběhu řešení byly vypracovány původní metody třídění chromozomů ječmene pomocí laserové průtokové cytometrie a konstrukce chromozomově specifických knihoven DNA

Zahájení řešení

1. 1. 2000

Ukončení řešení

1. 1. 2002

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2003/MSM/MSM3ME/U/N/8:4

Datum dodání záznamu

22. 5. 2009

Celkové uznané náklady

2 224 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

667 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

1 612 tis. Kč