Využití genových ontologiií a anotací pro interpretaci dat genové exprese prostřednictvím algoritmů relačního strojového učení

Název projektu anglicky
Using gene ontologies and annotations for gene expression data interpretation through relational machine learning algorithms
Anotace anglicky
The objective of the project is to develop algorithms and their software implementations enabling the interpretation of gene expression data by exploiting databases of gene ontologies and annotations, using methods of relational machine learning and relational data mining. In particular, within the proposed 4 project years we aim at developing a platform for the relational integration of gene expression data, gene ontologies and text annotations, mutual gene interactions data, genetic regulatory pathways structure information as well as ontologies of such pathways. On this platform, we aim at devising algorithms for inductive knowledge discovery, emphasising tasks fo predictive classification, association and outlier values detection as well as descriptive tasks such as the discovery of statistically significant relational subgroups or relational hierarhical clustering.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace
CEP - vedlejší obor
JC - Počítačový hardware a software
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>20206 - Computer hardware and architecture

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rozsáhlých experimentech byly testovány metody pro klasifikaci dat genové exprese pomocí genových množin a vhodnost těchto metod byla potvrzena se statistickou významností. Byly implementovány nové moduly do veřejně přístupného nástroje XGENE.ORG pro ?

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP11-MSM-ME-U/01:1
Datum dodání záznamu
30. 6. 2011

Cíle projektu