Využití metagenomických přístupů pro studium mikrobiální diversity a jejich změn v podmínkách environmentálního stresu

Název projektu anglicky
Metagenomic approaches for studying of microbial diversity at environmentally stressed conditions
Anotace anglicky
The main goal of the project is employment of metagenomic approaches (molecular biology and analytical techniques, analysis of 16SrDNA, ribosomal proteins, functional genes for catabolic enzymes, production of toxins) for characterization of key factors,determining taxonomical and functional diversity of microbial populations dominating in the environment and stressed by different conditions. The profit of such approach is based on possibility to characterize culturable but also non-culturable microbesand characterize their abilities and function on level of DNA (RNA). We suppose to find linkages, interactions and relations critical for indigenous microbial populations in stressed soil systems as a consequence of the effect of different biotic and abiotic factors (presence of allochtonous populations, addition of unusual substrates, presence of plants including transgenic ones, etc.). In frame of the project different molecular biology and analytical methods allowing identification on the level of

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EH - Ekologie – společenstva
CEP - vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory (dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) 10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3) 10605 - Developmental biology 10606 - Microbiology 10607 - Virology 10608 - Biochemistry and molecular biology 10609 - Biochemical research methods 10618 - Ecology 10619 - Biodiversity conservation 30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci projektu byla optimalizována metoda analýzy pyrosekvenačních dat, která je vhodná pro studium taxonomické i metabolické diversity bakterií v životním prostředí. S využitím této metodiky spolu s analýzou obsahu kontaminantů v zemině bylo zjištěno?

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP13-MSM-ME-U/01:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2013

Cíle projektu