Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III

Veřejná soutěž

VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 1 (SMZ0201001)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NT11159-5/2010

Název projektu anglicky

Molecular typing of syphilis-causing strains in the Czech Republic and detection of mutations leading to macrolide resistance

Anotace anglicky

Whole genome sequencing of several strains of Treponema pallidum (TP, i.e. strains Nichols, SS14, Mexico A and DAL-1) allowed development of highly specific PCR diagnostics that enabled typing of TP by sequencing of variable genomic loci. Moreover, the obtained TP DNA from patients will be also tested on the presence of macrolide resistance-causing mutations in the TP genome. The proposal plans to collect TP samples (mainly genitoanal swabs and whole blood samples) from several regions of Czech Republic. The DNA extracted from clinical samples will be amplified and sequenced in several chromosomal loci including TP0136 and TP0548 genes and in the macrolide resistance locus. The obtained sequences will be analyzed and clustered and confronted with the epidemiological data. In addition, development of fast, reliable and cheap diagnostic tests for molecular typing of syphilis-causing treponemes is planned.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výstupy mají značný význampro pochopení epidemiologie treponem. infekcí v ČR i v celém světě.Z praktického hlediska je velmi důležitý údaj o rezistenci T.pallidum k makrolidům (67%),což znamená,že tato ATB nelze považovat za léky volby sifilidy.

Zahájení řešení

1. 9. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-MZ0-NT-U/05:3

Datum dodání záznamu

14. 12. 2015

Celkové uznané náklady

7 231 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 231 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč