DNA fingerprinting u chronické myeloidní leukémie

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III

Veřejná soutěž

VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 1 (SMZ0201001)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NT11555-6/2010

Název projektu anglicky

DNA fingerprinting in chronic myeloid leukemia

Anotace anglicky

We will create unique DNA and DNA methylation fingerprints in CML patients in different stages of the disease and responses to TKIs using AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism). Cluster analysis and analysis of principal components will divide patients to groups based on genetic and epigenetic background. We will evaluate the concordance of such clustering with data obtained from routine monitoring of known markers indicating prognosis and response to treatment in CML. AFLP profiling enables to identify new targets in DNA for new prognostic and diagnostic markers development. Project will enable to validate analyses (mutation detection in BCR-ABL kinase domain by HRM prescreening, WT1 and its main splicing variants gene expression, gene expression of imatinib influx and efflux transporters, the phosphorylation level of important proteins), which have been developed in our project IGA MZCR NR/8758-3 (2006-2008) “Early markers of resistance to imatinib in chronic myeloid leukemia“.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

FD - Onkologie a hematologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Charakterizací AFLP fragmentů a jejich sekvenací byly identifikovány převážně jednobodové polymorfismy, které statisticky významně souvisejí s CML a s rezistencí pacientů na kéčbu imatinibem.

Zahájení řešení

1. 9. 2010

Ukončení řešení

30. 6. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-MZ0-NT-U/02:1

Datum dodání záznamu

19. 12. 2016

Celkové uznané náklady

8 208 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 316 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

892 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč