Potenciál přínosu PCR-HRMA a MALDI-TOF spektrometrie v identifikaci a typizaci bakteriálních patogenů – posouzení na modelu CHOPN, bronchiektázií a cystické fibrózy

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III

Veřejná soutěž

VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 3 (SMZ0201201)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NT13560-4/2012

Název projektu anglicky

Contributing potential of MALDI-TOF spectrometry and HRMA in identification and typing of bacterial pathogens – evaluation on the model of COPD, bronchiectasis and cystic fibrosis

Anotace anglicky

The project consists in a conclusive prospective study of performance of MALDI-TOF spectrometry and High Resolution Melting Analysis of PCR-products (PCR-HRMA) in species identification, and MALDI-TOF and McRAPD in strain typing, compared to reference techniques (16S rDNA sequencing and MLST). For species identification purposes, a commercial MALDI-TOF approach and a published PCR-HRMA approach will be tested. For typing, MALDI-TOF and McRAPD will be tested in Haemophilus influenzae strains. This testing will be performed on bacterial isolates recovered from sputum samples of patients suffering Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD), Bronchiectasis (BE), and Cystic Fibrosis (CF). Accuracy and reproducibility will be determined for identification techniques and power of resolution for typing techniques. Based on evaluation of clinical data, the true contributing potential of the techniques to improve clinical management will also be estimated.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt hodnotil užitečnost PCR s analýzou křivek tání produktů v určování druhů vybraných respiračních patogenů a obdobně modifikované metody Random Amplified Polymorphic DNA v genotypizaci Haemophilus influenzae.

Zahájení řešení

1. 4. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

20. 3. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-MZ0-NT-U/02:1

Datum dodání záznamu

19. 12. 2016

Celkové uznané náklady

3 539 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 539 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč