Analýza genomu nemocných s chronickou lymfocytární leukemií (CLL) metodou arrayCGH s vysokým rozlišením s cílem identifikovat nové podskupiny nemocných pro prognostickou stratifikaci a optimalizaci léčebného přístupu.
Cíle projektu
Využití čipových technologií a metod molekulární genetiky pro studium genových změn v nádorovém genomu nemocných s CLL s cílem určit genetické změny prognostického významu a tyto poznatky využít ke studiu role a významu genetických změn v patogenezi onemocnění a cílené léčbě "šité na míru". Projekt bude: A) metodou arrayCGH s oligonukleotidovými, SNPs a chromosomově specifickými čipy analyzovat genom nemocných s CLL v době diagnózy a průběhu onemocnění B) pomocí metod molekulární cytogenetiky mapovat zlomová místa na chromosomech 6, 11 a 13 C) pomocí molekulárně genetických metod (např. RT-PCR, Q-RT-PCR, HRMC) sledovat expresi vybraných genů včetně miRNA D) pomocí analýzy proteinů sledovat signální dráhy odpovědi na poškozenou DNA E) pomocí analýzy klinických dat chceme co nejpřesněji prognosticky charakterizovat nepříznivé podskupiny nemocných a najít pro ně optimální léčebný přístup využívající cílenou léčbou šitou na míru
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III
Veřejná soutěž
VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 3 (SMZ0201201)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NT13576-4/2012
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Integrated genomic analysis of chronic lymphocytic leukemia (CLL) for genetic and clinical identification of subgroups with aberrations of selected chromosomes.
Anotace anglicky
To use chip technologies and molecular genetic methods in the study of gene changes in the tumor genome of patients with CLL to determine genetic changes of a prognostic significance and to acquire knowledge applied in studying the role and impact of genetic changes in the pathogenesis of CLL. Based on the knowledge: A) the arrayCGH method with oligonucleotide, SNPs and chromosome-specific chips will be used to analyze the genome of CLL patients at diagnosis and in the course of the disease B) arrayCGH and FISH with specific probes will be used for mapping the breakpoints in patients with changes on chromosomes 6, 11 and 13 C) molecular genetic methods (e.g. RT-PCR, Q-RT-PCR, sequencing) will be used to study expression of selected genes and other potential candidate genes D) the protein analysis will be used to follow signaling pathways of DNA damage response (DDR) E) clinical data will be analyzed to obtain detailed clinically prognostic characteristics of the analyzed subgroups of patients
Vědní obory
Kategorie VaV
NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)
CEP - hlavní obor
FE - Ostatní obory vnitřního lékařství
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
FD - Onkologie a hematologie
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30204 - Oncology
30205 - Hematology
30217 - Urology and nephrology
30218 - General and internal medicine
30219 - Gastroenterology and hepatology
30220 - Andrology
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Výsledky řešení projektu rozšířily naše poznatky v problematice genetických aberací u CLL.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 4. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2015
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
20. 3. 2015
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP16-MZ0-NT-U/02:1
Datum dodání záznamu
19. 12. 2016
Finance
Celkové uznané náklady
9 477 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 477 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
9 477 tis. Kč
Statní podpora
9 477 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
CEP
FE - Ostatní obory vnitřního lékařství
Doba řešení
01. 04. 2012 - 31. 12. 2015