Celogenomové sekvenování a metagenomika jako nástroje k pochopení cest přenosu bakterií rezistentních k antibiotikům z nemocnic do prostředí

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
Veřejná soutěž
SMZ0202000001
Hlavní účastníci
Veterinární univerzita Brno / CEITEC - Středoevropský technologický institut, VFU Brno
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NU20J-09-00040

Název projektu anglicky
Whole genome sequencing and metagenomics towards understanding transmission routes of antibiotic resistant bacteria from hospitals to the environment
Anotace anglicky
Dissemination of antibiotic resistant bacteria represents a top clinical challenge. Enterobacterales order, especially Escherichia coli and Klebsiella spp., is among the most common agents of urinary tract and other severe infections and is commonly resistant to multiple antibiotics. Resistant bacteria can spread from hospitals via raw sewage to urban wastewater treatment plants and into surface waters. This project is focused on revealing complex transmission routes of antibiotic resistance from hospitals to the environment using culture-dependent and -independent sequencing approaches. Whole genome sequencing will provide genetic context of clinically important bacterial clones. Metagenomics will enable characterization of complex bacterial populations, detection of genetic markers of interest (resistance and virulence genes, mobile genetic elements) and the investigation of silent sources of antibiotic resistance. Such a combined approach will reveal the spread of resistant bacteria and clinically and epidemiologically relevant elements from hospitals into the environment.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30302 - Epidemiology
OECD FORD - vedlejší obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie<br>FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
1/ Odborný přínos projektu lze vidět v tom, že přinesl řadu prioritních zjištění, která byla publikována v kvalitních mezinárodních periodicích. Sledováním cest šíření různých druhů bakterií z nemocnic do odpadních vod a přes čistírny odpadních vod do životního prostředí projekt přinesl přehled o šíření antibiotické resistence z nemocnic a přispěl k budoucímu návrhu postupů a doporučení pro efektivní monitoring. 2/ Charakteristika výsledků: výsledky jsou adekvátní cílům, které byly splněny. 3/ Význam projektu pro jiné obory: jedná se o multidisciplinární projekt, jehož výsledky přispěly k metodické úrovni sledování kontaminace odpadních vod potenciálně rezistentními baktériemi a poslouží k výchově studentů. 4/ Výstupem projektu jsou tři publikace v odborných recenzovaných časopisech s impakt faktorem a uvedenou dedikací. 5/ Nedostatky v dodržování Zadávací dokumentace nebo v čerpání finančních prostředků nebyly shledány, odchylky byly řádně zdůvodněny.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-MZ0-NU-U
Datum dodání záznamu
3. 7. 2024

Podobné projekty(10)