Prospektivní studie na včasnou detekci karcinomu pankreatu a sledování průběhu léčby na základě lipidomického profilování hmotnostní spektrometrií

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202100001

Hlavní účastníci

Univerzita Pardubice / Fakulta chemicko-technologická

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU21-03-00499

Název projektu anglicky

Prospective study on early pancreatic cancer detection and therapy monitoring using lipidomic profiling by mass spectrometry

Anotace anglicky

This project deals with the lipidomic analysis of human serum and tumor tissues of pancreatic cancer patients in comparison to healthy controls. The prospective collection of serum and tissue samples together with the collection of clinical information and measurements of basic clinical parameters will be performed at FN Olomouc, FN Hradec Králové, and Medical Faculty of Palacký University in Olomouc. The set of retrospective samples from biobank at FN Olomouc will be used for the purpose of optimization of analytical methodology at University of Pardubice with the goal to quantify at least 200 lipids from 5 lipid categories (phospholipids, sphingolipids, glycerolipids, sterols, and fatty acyls). The whole workflow will be optimized in respect to future routine use in the clinical laboratory, which means the use of low-resolution triple quadrupole mass spectrometer that is becoming a common equipment of clinical laboratories. Statistical models based on multivariate data analysis will be prepared for the differentiation of patients and healthy controls including the determination of accuracy, sensitivity, and specificity. Other task is the monitoring of treatment in correlation with lipidomic profiles of patient sera. All obtained clinical and analytical data will be evaluated using modern bioinformatics approaches with the goal to find the most dysregulated lipids for the pancreatic cancer. Based on previous results, the most downregulated lipids are monounsaturated sphingomyelins with long-chain fatty acyls (SM 41:1, SM 39:1, SM 42:1, etc.) and upregulated phospholipids and sphingolipids containing combinations of 16:0 and 18:1 fatty acyls. Finally, the whole methodology will be translated to VFN Prague to verify the applicability of whole approach at conditions of clinical laboratory. The aim is the optimization of whole workflows starting from the sample collection up to reporting results and the preparation of this method for subsequent clinical validation.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10406 - Analytical chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CB - Analytická chemie, separace

Zahájení řešení

1. 5. 2021

Ukončení řešení

31. 12. 2024

Poslední stav řešení

K - Končící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NU-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2024

Celkové uznané náklady

14 007 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 007 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč