Nové přístupy ke studiu selhání léčby giardiózy: využití next-gen sekvenování a digital PCR k identifikaci markerů rezistence parazita.

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202300001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU23-05-00441

Název projektu anglicky

New approaches to addressing giardiasis treatment failure: the employment of next-generation sequencing and digital PCR in the search for markers of parasite drug resistance. e.

Anotace anglicky

Giardiasis, the world's most common intestinal disease of protozoan origin with approximately 280 million symptomatic cases per year, has been a dificult treat infections in recent years, especially in developed countries, including the Czech Republic. In the Czech Republic, more than a hundred cases are diagnosed each year, a third of which do not even respond to the increased dosage of metronidazole (MTZ), the drug of choice and the only registered drug against giardiasis in our country. Most patients with clinically resistant giardiasis are subsequently treated with a combination of tinidazole or ornidazole and albendazole, which are not registered in the Czech Republic. In these cases, the delay between diagnosis and the initiation of effective therapy could be eliminated by laboratory markers that would detect resistance immediately upon detection. However, such markers are not available. A sufficiently large set of clinical samples from patients with clinically resistant and sensitive giardiasis to MTZ is a prerequisite for the search for markers of resistance. The aim of the present project is therefore to collect Giardia isolates / DNA from these cases and to verify hypotheses about genetic conditionality of resistance based on identification of mutant alleles and gene duplication of candidate genes as possible markers of resistance. The overall picture will be supplemented by a gene expression study monitoring the response of resistant Giardia strains to different concentrations of MTZ. In the case of identification of stable differences at the genetic level between isolates from cases of giardiasis with clinical resistance/sensitivity to MTZ resp. with proven in vitro MTZ resistance/susceptibility, these differences will be used to develop procedures for routine identification of resistant isolates, and thus as markers of giardiasis resistance to MTZ, enabling early administration of causal combination therapy.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

30303 - Infectious Diseases

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie<br>FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

Zahájení řešení

1. 5. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NU-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2024

Celkové uznané náklady

13 030 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

13 030 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč