Celogenomové sekvenování pro studium epidemiologie stafylokoků a analýza genetických a fyziologických rysů spojených s šířením meticilin rezistentních i citlivých kmenů Staphylococcus aureus a koaguláza negativních stafylokoků.

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026

Veřejná soutěž

SMZ0202300001

Hlavní účastníci

Fakultní nemocnice v Motole

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NU23-09-00080

Název projektu anglicky

Whole-genome sequencing-based epidemiology and analysis of genetic and physiological features that are associated with the spread of methicillin-resistant and susceptible strains of Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci.

Anotace anglicky

Staphylococci are important pathogenic bacteria capable of causing a wide range of infections. According to the WHO, S. aureus, represented by methicillin-resistant strains (MRSA), is a major threat to global health. In contrast to the clear clinical importance of S. aureus, coagulase-negative staphylococci (CoNS) have not been considered true pathogens. However, with the development of modern medicine, CoNS (S. epidermidis, S. haemolyticus) have been recognized as important pathogens and some of the most important causative agents of hospital-acquired infections, often exhibiting multiple antibiotic resistance. CoNS represent a source of resistance genes for S. aureus, and recent studies have shown that dominant hospital lines of S. epidermidis, have acquired cell wall modifications that increase the transfer of genetic information to or from S. aureus. In line with the priorities of the call, the objective of the proposed project is to study the molecular epidemiology of S. aureus and coagulase-negative staphylococci, including strains with resistance to methicillin and other antibiotics, occurring in the Czech Republic. We will analyse S. aureus, MRSA and CoNS isolates from the Czech Republic and Motol University Hospital. The isolates will be analysed by whole-genome sequencing (WGS) to identify epidemic clones of MSSA, MRSA and SKN, and to describe resistance and virulence genes carried by these strains. Subsequently, isolates from the dominant epidemic lineages will be analysed for growth characteristics, ability to compete with other staphylococcal strains and species, biofilm formation, production of virulence factors, persistence, heteroresistance and tolerance to antimicrobials. The data obtained will be correlated with the genetic analysis of the isolates using WGS. The project will provide a deeper understanding of the epidemiology of S. aureus and CoNS in the Czech Republic, including the characteristics that contribute to the spread of epidemic clon

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

30303 - Infectious Diseases

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie<br>FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

Zahájení řešení

1. 5. 2023

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NU-R

Datum dodání záznamu

21. 2. 2024

Celkové uznané náklady

5 141 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 141 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč