Analýza interakcí nádorových buněk s mikroprostředím metodami hmotnostní cytometrie a proteinových arrays

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-26588A

Název projektu anglicky
Analysis of interactions between tumor cells and microenvironment using mass cytometry and protein arrays
Anotace anglicky
Proposed project will develop a technological platform for investigation of complex suspension tissues (peripheral blood, bone marrow and CUSA aspirates) that contain a tumor infiltration. The approach would combine and complement two innovative high-content approaches: a single cell mass cytometry (“cancer cytomics”) to determine changes in cellular composition of tumor affected tissue and SEC-MAP array (“proteomics”) to determine changes in proteome of tumor cells. First, a reference of normal cellular development will be established for bone marrow resident B-cells to which abnormal (leukemic) cells could be compared in search for biomarkers. Next, SEC-MAP will be used to determine tumor specific proteome changes (in leukemia and in brain tumors as a model). Last, useful biomarkers will be built into single cells analysis by mass cytometry panels for “cancer cytomics” investigation. Bioinformatic tools will be developed to enable understanding the complex data.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
FD - Onkologie a hematologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V rámci řešení projektu byly vyvinuty, otestovány a implementovány nové postupy využívající kombinaci průtokové cytometrie, hmotnostní spektrometrie a proteomiky. Zejména se podařilo vyvinout techniku pro izolaci buněk pro hmotnostně cytometrické analýzy na bázi exprese znaku CD81, podařilo se analyzovat více jak 100 CD znaků na 47 buněčných populacích krve, thymu a tonzil, podařilo se analyzovat více jak 500 antigenů na několika desítkách vzorků leukemických buněk, a byl sestaven panel o 35 znacích pro hmotnostně cytometrické rozlišení různých typů leukocytů. Tyto a další výsledky jsou plně adekvátní a není pochyb o jejich vědecké i medicínské závažnosti. Zejména díky svému metodickému charakteru jsou výsledky jsou charakteristické vysokou mírou aplikovatelnosti v buněčné biologii a klinické medicíně. V rámci řešení projektu byly publikovány tři práce ve špičkových časopisech, a výsledky byly prezentovány na několika relevantních konferencích. Projekt byl řešen v souladu se zadá

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP19-MZ0-NV-U/02:1
Datum dodání záznamu
16. 9. 2019

Podobné projekty(10)