Proteomická analýza molekulárních podtypů meduloblastomu: odhalení klinicky významných markerů

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023

Veřejná soutěž

Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)

Hlavní účastníci

Fakultní nemocnice Brno

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-30657A

Název projektu anglicky

Proteomic analysis of medulloblastoma molecular subgroups: discovery of novel clinically relevant markers

Anotace anglicky

Ten percent of all cancer related deaths in children are caused by medulloblastoma. The recent molecular classification of medulloblastoma has prognostic impact. However, it is based on transcriptome-arrays that are not suitable for daily diagnostic practice. In this project, using our established quantitative proteomics-based target discovery program, we propose to identify and validate protein-based markers of molecular subgroups (i.e. WNT, SHH, Group 3, Group 4). Proteins with impact on clinical presentation and prognoses will be defined also within the subgroups. Other expected results of the project validate our hypothesis that tetraspanins and other membrane proteins (e.g. chloride intracellular channel 1) are involved in pathogenesis and are differentially expressed in medulloblastoma molecular subgroups. This knowledge is expected to result to the robust and reliable immunohistochemical tests for routine diagnostics of medulloblastoma subgroups and could be a basis for development of targeted therapies using membrane proteins involved in medulloblastoma tumorigenesis.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

FG - Pediatrie

CEP - vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology<br>30209 - Paediatrics

Hodnocení poskytovatelem

O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

Zhodnocení výsledků projektu

Řešitelé provedli úspěšnou analýzu proteinových klastrů v jednotlivých molekulárních podskupinách lokalizovaného a metastazovaného meduloblastomu. Proteomická analýza meduloblastomů skupin 3 a 4 přinesla rozdíly v expresi vybraných proteinů až po změně sofwaru pro bioinformatické zpracování dat po re-analýze již získaných výsledků v roce 2018. To zapříčinilo zpoždění přípravy publikace z řešení grantu. Výsledky prezentované v závěrečné zprávě tak nejsou obhájeny publikací v recenzovaném časopisu. Další z plánovaných výzkumných cílů - hypotézu o podílu membránových proteinů v patogenezi meduloblastomu se imunohistochemickou detekcí na parafinových řezech nezdařilo potvrdit. Podobně nepřinesla předpokládané výsledky funkční studie na buněčných liniích s cílem ovlivnit signální dráhu SHH.

Zahájení řešení

1. 5. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 6. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-MZ0-NV-U/01:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2019

Celkové uznané náklady

7 366 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 366 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč