Vývoj a standardizace metody analýzy přestaveb genů pro antigení receptory pomocí sekvenování nové generace pro využití v imunohematologii

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023

Veřejná soutěž

Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-32568A

Název projektu anglicky

The development and standardization of method for analysis of antigen receptor gene rearrangements using next generation sequencing for use in immunoh

Anotace anglicky

Next generation sequencing (NGS) has opened a unique possibility to sequence all rearrangements of immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TR) genes in biologic samples. Several groups including ours already presented data on the usefulness of NGS Ig/TR detection for the assessment of minimal residual disease (MRD) in lymphoid malignancies and for the evaluation of the entire immune spectrum in various normal and pathologic conditions. However, despite many advantages, the methodology still suffers from serious flaws, which prevent the introduction of the method into routine diagnostics. The aim of this project is (i) to develop and standardise in international collaboration several types of NGS Ig/TR assays for MRD detection in lymphoproliferative neoplasms, (ii) to prospectively evaluate the feasibility and performance of the new NGS-based approach compared to current gold standard methods (quantitative PCR and flow cytometry) in a cohort of patients with acute lymphoblastic leukemia.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

EC - Imunologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30102 - Immunology<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Celkově velmi kvalitně řešený projekt, bez zjevných nedostatků. Projekt výrazně přispěl za pomoci nejmodernějších přístupů k rozvoji precizních diagnostických metod v oblasti hematoonkologie. Je vysoce pravděpodobné , že výsledky projektu budou v krátkém časovém horizontu implementovány a široce využívány v klinické praxi nejen u nás, ale i v zahraničí. Hlavním odborným přínosem projektu je rozvoj a standardizace moderních metod na principu NGS pro detekci klonality buněk u ALL, ale s jasným přesahem i pro další hematologické malignity. Výsledky mají okamžité využití v klinické praxi (zavedený SOP) a výrazně vylepšují či nahrazují stávající postupy. Kvantitativně je projekt rovněž splněn - výstupy projektu jsou 3 původní práce a 1 přehledový článek v kvalitních mezinárodních odborných časopisech (Jimp) a 1 přehledový článek v českém neimpaktovaném periodiku. Původně předpokládané cíle (2publikace) byly tedy výrazně překonány. Hospodaření projektu proběhlo bez významnějších odchylek od

Zahájení řešení

1. 4. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 6. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-MZ0-NV-U/03:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2020

Celkové uznané náklady

9 663 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 663 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč