Encyklopedie CLL podskupin: unikátní znalostní databáze vybavená bioinformatickými nástroji použitelná v personalizované biomedicíně a klinické praxi

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 2 (SMZ0201601)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
16-34272A

Název projektu anglicky
Encyclopedia of CLL Subsets: a unique knowledgebase and novel bioinformatics tools towards personalised biomedical and clinical applications
Anotace anglicky
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is the most common adult leukemia in the West, biologically and clinically heterogeneous with varying clinical outcome, and currently incurable. Remarkably, highly similar, or stereotyped, B cell receptors can be identified in one out of three CLL patients – leading to their inclusion in subsets of cases, or CLL subsets, with intriguing homogeneity in clinical presentation and outcome as well as biological features. Our bioinformatics-heavy proposal is to design, populate, analyse, ‘equip’, and share the Encyclopedia of CLL Subsets. It has the ambition to guide research, development, and application of CLL subsets in a linkable and comparable way, becoming a much-needed reference point for the field. And by connecting new CLL cases to an encyclopedia rich with up-to-date knowledge, it will eventually enable personalised biomedical applications, such as the use of novel predictive biomarkers and treatment targets, and the design of effective therapy – with an impact on many tens of thousands of patients.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
FD - Onkologie a hematologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Bioinformatická analýza je základním předpokladem úspěšné implementace molekulárně genetických metod NextGen do výzkumné práce i klinické praxe. N.Darzentas a jeho tým vyvinuli platformu ARResT (Antigen Receptors Research Tools), která propojuje sekvenční, klinická a publikační data a slouží k analýzám publikovaným evropským sdružením EuroClonality-NGS v špičkových hematologických časopisech oboru (Leukemia - IF 9,9), které N.Darzentas přikládá k závěrečné zprávě a jsou opatřeny dedikací projektu. Řešitel splnil cíle projektu, výsledky řešení jsou v podobě instalovaného nástroje CLL Subsets na veřejně přístupném serveru a jsou podpořeny publikací. Široké spektrum kvalitních výstupů v rámci celého systému ARResT dokládá významnou roli řešitele v mezinárodních vědeckých týmech, využívajících tuto platformu pro svůj výzkum.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-MZ0-NV-U/03:1
Datum dodání záznamu
1. 7. 2020

Podobné projekty(10)