Variabilita a změny ve složení nazofaryngeálního mikrobiomu u pacientů s transplantací kmenových krvetvorných buněk

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 3 (SMZ0201701)
Hlavní účastníci
Fakultní nemocnice Hradec Králové
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-28539A

Název projektu anglicky
Variability and composition of nasopharyngeal microbiota in receiving hematopoietic stem cell transplantation
Anotace anglicky
The introduction of next-generation sequencing (NGS) has allowed research of human microbiome. As was demonstrated in studies of the vaginal or gastrointestinal microbiome representation of certain phyla play an irreplaceable role in maintaining of optimal composition of the microbiome. Patients undergoing hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) are at risk of infectious complications, whose source is usually endogenous microbiota. In the late post-transplant period, patients are susceptible to infections caused by encapsulated pathogens as Streptococcus pneumoniae, which is the part of the commensal nasopharyngeal microflora. The change in the composition of nasopharyngeal microflora may contribute to the development of pneumococcal colonization. Using NGS the detailed composition and variability of nasopharyngeal microbiome in patients undergoing HSCT will be studied, as it is composition may be affected in these patients due to repeated exposure to the antibiotic and the absence of certain microbes may contribute to increased susceptibility to pneumococcal infections.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
1. Odborný přínos projektu: Řešitelé projektu splnili původně plánované cíle a to zejména v bodech týkajících se studia rozmanitosti a dynamiky bakteriálního osídlení nasofaryngu u pacientů podstupujících transplantaci krvetvorných buněk. Zvláštní pozornost byla věnována streptokokům. Byla zavedena metoda sekvenování nové generace (NGS) S16 rRNA mikrobiomu a zjištěno, že přináší významnou přidanou hodnotu k metodám konvenčním, např. kultivačním. Dále bylo zjištěno, že kombinace genů pro detekci pneumokoků metodou kvantitativního PCR v reálném čase je vhodnější ve srovnání s postupem založeným na jednom genu. Lze tedy konstatovat, že hlavním dosavadním přínosem projektu je získání zkušeností se sekvenováním nové generace pro řešitelské pracoviště a publikace výsledků. Původně specifikovaná zahraniční spolupráce s pracovišti v Portugalsku a Švédsku nebyla, dle analýzy publikací, využita. Hlavním výsledkem řešení projektu je 5 prací v impaktovaných časopisech. 2. Charakteristika výsle

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Datum dodání záznamu
25. 6. 2021

Podobné projekty(10)