Využití metod paralelního sekvenování pro monitorování dynamiky orálního mikrobiomu v průběhu rozvoje a terapie onemocnění parodontu.

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 3 (SMZ0201701)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-30753A

Název projektu anglicky
Use of parallel sequencing methods for monitoring of oral microbiome dynamics in the course of periodontal disease development and therapy.
Anotace anglicky
The aim of the project is to evaluate the applicability of high throughput sequencing (HTS) as a tool for complex characterization of oral microbiome dynamics and thus for early diagnosis of risk and onset of periodontitis and for monitoring of treatment. The 7-year long-term study exploring the dynamics of changes in the oral microbiome composition in already established group of 20 initially healthy subjects and a control group of patients with chronic periodontitis will document in detail the transformation of "healthy" bacterial biofilm into the periodontal one. The HTS will be employed also for monitoring of oral microbiome during and after the therapy of a group of 60 patients with aggressive periodontitis treated by either of two standard procedures. Comparison of outputs of both experiments will reveal, whether the composition of subgingival biofilm differs in chronic and aggressive periodontitis. The complex methodological procedure for HTS integration into system of early diagnosis and treatment of patients with periodontitis will be developed.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
OECD FORD - odpovídající obory (dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3) 10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3) 10605 - Developmental biology 10606 - Microbiology 10607 - Virology 10608 - Biochemistry and molecular biology 10609 - Biochemical research methods 30101 - Human genetics 30302 - Epidemiology 30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Zhodnocení výsledků projektu
Cíle projektu byly splněny, výstupy projektu jsou dvě kvalitní publikace v impaktovaném časopisu a software k použití v klinické praxi, které představují posun v poznání dané problematiky. Nebyl však splněn počet uznatelných hlavních výstupů projektů deklarovaných v projektovém návrhu (4 Jimp), na základě kterého byl projekt doporučen k financování. Za uznatelné hlavní výstupy nelze považovat publikace, které nesouvisí s tématem projektu a/nebo byly do redakce zaslány ještě před začátkem projektu. Na žádost řešitele byla prodloužena doba řešení projektu o půl roku z důvodu pandemie COVID-19 a s tím souvisejících komplikací při klinickém vyšetření pacientů a odběru vzorků. Finanční prostředky byly v rámci projektu čerpány adekvátně, z plánovaných 9 445 tis. Kč bylo čerpáno 9 390 tis. Kč.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
24. 1. 2022

Podobné projekty(10)