Integrální analýza celogenomového sekvenování a mnohobarevné cytometrie - nástroj ke zlepšení diagnostiky a monitorování dětských akutních leukemií

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 4 (SMZ0201800001)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV18-08-00385

Název projektu anglicky
Integrative analysis of high-throughput genomics and multiparameter flow cytometry to improve diagnosis and monitoring of childhood acute leukemia
Anotace anglicky
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most frequent cancer in children. Its improving outcome depends on accurate diagnosis and minimal residual disease (MRD) monitoring as done by flow cytometry. In proposed project we will develop automatic tools usable in clinical setting to analyse large numbers of multidimensional flow cytometry datasets. This will allow for clinical relevant categorisation of leukemias based on their immunophenotypes (LAIPs) with respect to outcome and other clinical features. Likewise better description of LAIPs dynamics and changes under treatment will allow for optimisation of MRD detection. Moreover, we will use whole genome data to associate genetic traits to immunophenotypes. Such integrative analysis will provide insights into relevance of genetic aberrations and their propagation into phenotype. Thus ultimately the combined analysis will lead to improvement of diagnostic of specific cancer subtypes and to better prediction of treatment outcome as well as rationalisation of costs of involved methods.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])
OECD FORD - vedlejší obor
30204 - Oncology
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FD - Onkologie a hematologie<br>FS - Lékařská zařízení, přístroje a vybavení

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt umožnil vyvinutí automatické analýzy dat multiparametrické cytometrie v kontextu s transkriptomovou analýzou u akutní lymfoblastické leukémie a představuje tak velký přínos v oboru biomedicínských technologií. Navíc přináší informace ohledně počítačově asistované charakterizace rekonstituce hematopoezy. Pozitivní korelace imunofenotypovách a genomových dat u hodnocené kohorty ALL pacientů nebyla jednonačně pozorována, nicméně i tak projekt přináší řadu cenných poznatků a podkladů pro další výzkum. Získaná data byla publikována, případně jsou připravována k publikaci. Projekt lze považovat za velmi úspěšný, vytyčené cíle byly splněny.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
30. 6. 2022

Podobné projekty(10)