Funkční metody pro rychlou mikrobiologickou diagnostiku vybraných infekcí spojených se zdravotní péčí

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Lékařská fakulta v Plzni
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-05-00541

Název projektu anglicky
Functional Assays for Rapid Microbiological Diagnostics of Selected Health-Care Associated Infections
Anotace anglicky
Health-care associated infections (HCAIs) significantly influence current medicine and may limit the progress in many medical procedures. Treatment of such infections has been increasingly complicated by the spread of antimicrobial resistance (AMR). To reduce risks of inappropriate initial therapy, the availability of rapid diagnostic microbiological assays is of utmost importance. Especially, functional diagnostics (i.e., detection of enzyme activity) is important in era of horizontal gene transfer. Functional assays for detection of selected bacterial toxins (ToxB of C. difficile and YopT of Y. enterocolitica) using affinity MALDI will be developed and validated. Simultaneously, functional assay for detection of carbapenemase activity developed in the laboratory of co-investigator will be further optimized and validated. Further, a new assay for functional detection of lipid A modification detecting colistin resistance will be also developed. All of those assays and tests represent a challenge for symptom-based microbiology and functional detection of important antibiotic resistance. Introduction of such assays to routine diagnostics will help to detect potentially unknown pathogens emerged because of horizontal gene transfer.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl řešen v souladu s plánovanými cíly, které se dařilo naplňovat. Podařilo se vyvinout několik metod založených na principu MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie, které mají potenciál zlepšit diagnostiku infekčních onemocnění. Především se jedná o detekci karbapenemáz typu OXA-48 na základě detekce tvorby beta-laktonu. Dále se podařilo vyvinout jednorázové terčíky pro MALDI-TOF MS analýzy pomocí 3D tisku z vodivého materiálu. V neposlední řadě byl vyvinut test pro funkční detekci toxinů A a B produkovaných Clostridioides difficile. Důležitý výsledek se týká i detekce prokalcitoninu, která, na rozdíl od konvenčních metod (ELISA), umožňuje detekovat i modifikované formy tohoto zánětlivého markeru. V případě detekce lipidu A lipopolysacharidu se podařilo vyvinout metodu extrakce celé molekuly, která umožní i typizaci mikrobů pomocí MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Výsledky tak mají výrazný aplikační potenciál. Výsledky byly publikovány ve 3 časopisech v Q1 a Q2, souhrnný IF 18.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
22. 6. 2023

Podobné projekty(10)