Identifikace prognostických markerů Escherichia coli u kolorektálního karcinomu a ex vivo charakterizace kmenů asociovaných s neoplazií

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2024-2030

Veřejná soutěž

SMZ0202400001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NW25-09-00323

Název projektu anglicky

Identification of Escherichia coli prognostic markers in colorectal cancer and evaluation of the neoplasia-associated strains ex vivo

Anotace anglicky

Colorectal carcinoma is one of the most common human malignancies. Its etiopathogenesis has not been fully elucidated; however, recent studies have shown that the composition of the large intestine microbiota plays an important role in tumorigenesis. Escherichia coli is considered a bacterial species involved in colorectal neoplasia. E. coli strains typically colonize the host at an early age and become stable gut residents. With the rising concern about the long-term consequences of certain E. coli strains on the host, there is a need to identify and screen neoplasia-prognostic markers. In our previous study, four genetic determinants of E. coli associated with neoplasia patients have been identified. Here, additional genetic factors associated with neoplasia will be identified by whole-genome characterization of the E. coli isolates from the previous study. Moreover, all identified neoplasia markers will be evaluated in ex vivo analysis of the adverse activities of neoplasia-associated E. coli. Since these E. coli strains appear to be persistent human residents, the risk value of the neoplasia markers will be analyzed in a prospective study of subjects investigated ten years ago using their medical records from biopsy to the present. At the end of the project, multiplex PCR detection will be developed for screening of the most robust prognostic markers for neoplasia-associated E. coli in fecal samples. The monitoring of the presence of the neoplasia markers would be useful, especially for individuals at risk (e.g., with family history) who may benefit from early recognition of the higher risk of potential neoplasia development.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie

Zahájení řešení

1. 5. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2028

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-MZ0-NW-R

Datum dodání záznamu

2. 4. 2025

Celkové uznané náklady

15 441 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

15 441 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč