Kvalita syntézy oligonukleotidového DNA - čipu

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

EUREKA - evropská spolupráce v oblasti aplikovaného a průmyslového výzkumu a vývoje cílená na podporu nadnárodní kooperace mezi průmyslovými podniky, výzkumnými ústavy a vysokými školami.

Veřejná soutěž

EUREKA 7 (SMSM2009OE4)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

1729/2010-32

Název projektu anglicky

Oligonucleotide DNA Micro-Array Synthesis Quality

Anotace anglicky

The aim of the project is to improve the quality of DNA microarrays produced by ink jet synthesizer and microarrayer. This will be achieved by means of designing and incorporating a real time sensor of the nozzle flow into the ink jet synthesizer and microarrayer and molecular-analytical output control. The nozzle flow sensor will monitor the occurrence, the position and the shape of the printed beads. After the nozzle gets clogged, the sensor will send a signal to the printing head and another nozzle will print the nucleotide on the effected spot. The molecular-analytical output control will analyze the quality of the final DNA microarrays by checking the density and oligonucleotide sequences and compare them to market-established products. Consequently, the errors in the oligonucleotide sequence that occur due to a random clogging of the nozzles will be eliminated. Moreover, the production process will increase in speed and become more effective as the double printing currently applied will no long

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

EI - Biotechnologie a bionika

CEP - vedlejší obor

JA - Elektronika a optoelektronika, elektrotechnika

CEP - další vedlejší obor

CD - Makromolekulární chemie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10404 - Polymer science<br>20201 - Electrical and electronic engineering<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledkem řešení projektu OLIGOSYNT je nový funkční vzorek snímacího zařízení pro snímání 3D tvarů, software pro analýzu obrazu DNA čipů, dvě kapitoly v odborných zahraničních knihách a odborný článek. Systém vizuální kontroly kontroly byl ověřen na prů?

Zahájení řešení

1. 4. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 3. 2011

Důvěrnost údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Systémové označení dodávky dat

CEP12-MSM-OE-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 7. 2012

Celkové uznané náklady

17 664 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 832 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

8 832 tis. Kč