NGS pro širokospektrální diagnostiku virových chorob rostlin a pro studium interakcí virus-hostitel

Poskytovatel

Technologická agentura ČR

Program

Program podpory aplikovaného výzkumu a experimentálního vývoje DELTA

Veřejná soutěž

DELTA 2 (STA02016TF02)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

2016TF02000056

Název projektu anglicky

Next generation sequencing (NGS) for the broad-spectrum diagnostics of plant viruses and for the study of virus-host interactions

Anotace anglicky

The aim of the project is: • To develop a methodology based on NGS for multiplex screening of small RNAs aiming on detection and determination of viral pathogens of cereals, including genome analysis of virome (set of viruses) in cereals • To develop reliable methods for detection and quantification of detected viral pathogens (from NGS) based on real-time (RT) -qPCR as a crop (wheat, barley, rice) specific tools for routine diagnostics • To study the profiles of small RNAs (miRNA, siRNA) in plant-host integration in a case study of barley/wheat genotypes-BYDV and rice genotypes-RBSDV interactions for the determination of gene regulation in response to viral infection at the level of RNA in accordance with plant resistance to the viruses.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Oponentní komise se shodla, že řešení tohoto projektu přispělo k cíli programu novými výsledky vhodnými k realizaci. Přínos projektu lze hodnotit jako celospolečenský. Dle dostupných informací spolupráce probíhala a přinesla řešitelskému týmu mnoho benefitů. Byla navázána nová partnerství a spolupráce je plánována i po skončení řešení projektu.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 2. 2019

Důvěrnost údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Systémové označení dodávky dat

CEP19-TA0-TF-U

Datum dodání záznamu

12. 5. 2023

Celkové uznané náklady

10 146 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 590 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

2 638 tis. Kč