Nové technologie identifikace a typizace biologických agens
Cíle projektu
Cílem projektu je vypracovat metodické postupy pro izolaci bakteriálních a virových nukleových kyselin a proteinových a neproteinových toxinů z přirozených matric, a dále pak postupy pro jejich identifikaci a typizaci. V případě bakterií a virů jsou navrženy následující metodické postupy a specifické technologické a laboratorní celky: získávání a kultivace biologickýc agens, izolace genomové a plasmidové DNA, resp. RNA v případě virů, metodiky a postupy přípravy vzorků bakteriálních a virových nukleových kyselin z komplexních matric, návrh qPCR primerů, sond, reakčních podmínek a ladění protokolů a otestování a validace navržených metod a postupů pro identifikaci biologických agens. Pro detekci nízkomolekulárních toxinů bude použita vysokoúčinná kapalinová chromatografie ve spojení s tandemovou hmotnostní spektrometrií a pro detekci a identifikaci proteinových toxinů bude použita hmotnostně spektrometrická metoda SRM (Selected reaction monitoring).
Klíčová slova
Bacteriavirusestoxinsnucleic acidsPCRliquid chromatographymass spectrometry
Veřejná podpora
Poskytovatel
Ministerstvo vnitra
Program
Bezpečnostní výzkum pro potřeby státu v letech 2010 až 2015
Veřejná soutěž
—
Hlavní účastníci
Ministerstvo obrany / Univerzita obrany - Vojenská lékařská fakulta
Druh soutěže
VZ - Veřejná zakázka
Číslo smlouvy
MV-103803-50/VZ-2010
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
New technologies for identification and typing of biological agents
Anotace anglicky
The aim of the project is to develop the methodological procedures for the isolation of bacterial and viral nucleic acids and protein and no-protein toxins from natural matrices, and the procedures for their identification and typing. In the case of bacteria and viruses are designed following the methodological procedures and specific technological and laboratory units: the acquisition and cultivation of biological agents, isolation of genome and plasmid DNA, or RNA in the case of a virus, the methodology and procedures for the preparation of samples of bacterial and viral nucleic acids from complex matrices, design of qPCR primers, probes and the reaction conditions and testing and validation of the proposed methods and procedures for the identification of biological agents. For the detection of low molecular weight toxins will be used high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry and for detection and identification of protein toxins will be used mass spectrometric method SRM(Selected reaction monitoring).
Vědní obory
Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
CB - Analytická chemie, separace
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10406 - Analytical chemistry
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10606 - Microbiology
10607 - Virology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cíle, stanovené v návrhu projektu, byly splněny. Hlavní výsledky projektu-Certifikované metodiky-byly dosaženy. V rámci projektu byly dále vykázán vedlejší výsledek. Všechny výsledky mají přímou vazbu k cílům projektu a vznikly během řešení projektu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
20. 4. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2015
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
12. 8. 2015
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP16-MV0-VF-U/05:1
Datum dodání záznamu
22. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
12 296 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
12 296 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
12 296 tis. Kč
Statní podpora
12 296 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Ministerstvo vnitra
CEP
EE - Mikrobiologie, virologie
Doba řešení
20. 04. 2012 - 31. 12. 2015