Využití mikrosatelitových markerů pro ověřování klonové identity a diverzity u lípy srdčité (Tilia cordata Mill.)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F19%3AN0000002" target="_blank" >RIV/00020702:_____/19:N0000002 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vulhm.cz/aktivity/vydavatelska-cinnost/lesnicky-pruvodce/" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/aktivity/vydavatelska-cinnost/lesnicky-pruvodce/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití mikrosatelitových markerů pro ověřování klonové identity a diverzity u lípy srdčité (Tilia cordata Mill.)

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem metodiky je představit postupy analýz DNA s využitím mikrosatelitových markerů pro získání genetických charakteristik u porostů lípy srdčité a pro objektivní ověřování deklarované identity klonů např. v semenných sadech nebo v klonových archivech. Metodika popisuje postupy odběru rostlinných vzorků, izolace DNA, podmínky polymerázové řetězové reakce, postupy fragmentační analýzy, hodnocení velikostí produktů amplifikace a statistické výpočty molekulárních dat. K vývoji této metodiky byl použit vybraný semenný sad lípy srdčité. Pro získání genetických parametrů za účelem ověření klonální identity a úrovně genetické rozmanitosti mezi různými genotypy bylo vybráno 8 polymorfních jaderných mikrosatelitových markerů.

Název v anglickém jazyce

Use of microsatellite markers for verification of clonal identity and diversity in small-leaved linden (Tilia cordata Mill)

Popis výsledku anglicky

The aim of this methodology is to present the use of DNA analyses by nuclear microsatellite markers to obtain genetic characteristics and introduce procedures for verifying the clonal identity in species of small-leaved linden. The methodology describes the processes of sampling, isolation of DNA, conditions of the polymerase chain reaction, separation and sizing of amplification products, and molecular data calculations. The selected seed orchard of small-leaved linden was used to develop this methodology. Eight selected polymorphic nuclear microsatellite markers proved suitable for finding the genetic parameters for verifying the clonal identity and levels of genetic diversity between different genotypes.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/QK1810258" target="_blank" >QK1810258: Návrh alternativní druhové skladby dřevin pro lesní ekosystémy se sníženou ekologickou stabilitou v důsledku fyziologického sucha</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

LP 4/2019

Číslo předpisu

63885/2019-MZE-16222/M197

Technické parametry

Smlouva o uplatnění metodiky č. CM-4/2019 byla uzavřena 22. 11. 2019 s Ústavem pro hospodářskou úpravu lesů Brandýs nad Labem, IČ: 00020681. Odpovědná osoba za uživatele metodiky: Ing. Jaromír Vašíček, CSc., ředitel, ÚHÚL, Brandýs nad Labem, Nábřežní 1326, 250 01 Brandýs nad Labem, e- mail: Vasicek.Jaromir@uhul.cz, tel. č. 321 021 111

Ekonomické parametry

Pro kalkulaci ekonomického přínosu lípy při použití kvalitního genetického zdroje se vycházelo z údajů o domácím obchodu s pilařskou kulatinou buku a kalkulovaný zvýšený čistý výnos představuje 41 726 Kč.ha-1. Pro uživatele znamená metodika finanční úsporu vynaloženou na vývoj postupů DNA analýz při určování klonové identifikace a zjišťování diverzity porostů lípy srdčité pro využití pro kontrolní mechanismy. Poznatky o diverzitě také podpoří využití genově bohatších porostů, odolnějším vůči změnám klimatu. Lze předpokládat i ekonomický přínos ve zvýšení tržeb z těžby dřeva u vlastníků lesa v podobě budoucích zvýšených výnosů z porostů založených kvalitním reprodukčním materiálem. Poznatky o diverzitě populací také napomáhají plnit cíle Státní politiky živ. prostředí a mezinárodní závazky ČR při ochraně biologické rozmanitosti, zároveň se naplňují cíle Národního programu ochrany a reprodukce genofondu lesních dřevin podporovat kvalitní genetické zdroje a ověřovat jejich identitu metodou DNA markerů.

Označení certifikačního orgánu

Ministerstvo zemědělství, Těšnov 17, Praha 1

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů