Využití biochemických metod pro identifikaci topolů odolných vůči suchu
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F20%3AN0000114" target="_blank" >RIV/00020702:_____/20:N0000114 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00020702:_____/20:N0000113
Výsledek na webu
<a href="https://www.vulhm.cz/files/uploads/2020/11/LP_1_2020.pdf" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/files/uploads/2020/11/LP_1_2020.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Využití biochemických metod pro identifikaci topolů odolných vůči suchu
Popis výsledku v původním jazyce
Cílem metodiky je popsat postup zpracování rostlinného materiálu k identifikaci jedinců topolu černého (Populus nigra L.) odolných k suchu. U vybraného kultivaru topolu černého cv. 797 byl představen postup získání výtěžku RNA v dostatečné kvalitě i kvantitě, která je elementární matricí pro přepis na komplementární DNA (cDNA) pomocí reakce reverzní transkripce (RT-PCR). Pro identifikaci jedinců topolu černého, odolných k suchu, byl uplatněn postup využití metody stanovení relativní exprese genů (qPCR) zapojených do odezvy na stres suchem. Nedílnou součástí metodiky je pracovní postup, který podrobněji popisuje jednotlivé kroky shrnuté v částech a) princip metody, b) materiální a technické zabezpečení, c) izolace RNA a odstranění genomové DNA, d) reverzní transkripce, e) qPCR a vyhodnocení získaných dat a f) identifikace topolů odolných vůči suchu. Metodické postupy, uplatněné pro identifikaci genů souvisejících s odezvou na stres suchem u topolu černého lze využít i pro další listnaté druhy lesních dřevin. Uvedený metodický postup jsme úspěšně vyzkoušeli např. i pro topol šedý (Populus ×canescens Aiton Sm.).
Název v anglickém jazyce
Use of biochemical methods for identification of drought resistant poplar species
Popis výsledku anglicky
As drought is currently one of a major environmental constraint with negative impact on forest productivity a high attention is devoted to this topic in this methodology. The work describes biochemical approaches focusing on woody plant samples preparation subsequently used for gene expression analysis at the mRNA level. Representative from deciduous species, black poplar (Populus nigra L.) cv. P797 was selected to identify its drought tolerance based on searching for drought responsive genes. The methodological procedures are in details described step by step focusing on isolation of total RNA in a good quality and quantity from poplar leaves, reaction leading to reverse transcription of mRNA into cDNA and quantitative real-time gene expression analysis (qPCR) following responses of several genes involved in drought stress. Obtained data from qPCR analysis enable us to evaluate and determine genes identifying tolerance to limited environmental conditions in poplar samples.
Klasifikace
Druh
N<sub>metC</sub> - Metodiky certifikované oprávněným orgánem
CEP obor
—
OECD FORD obor
40102 - Forestry
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/TJ02000217" target="_blank" >TJ02000217: Charakterizace vybraných druhů topolů a jejich odolnosti vůči suchu pomocí sekvenování nové generace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
LP 1/2020; CM-9/2020
Číslo předpisu
59352/2020-MZE-16222/M209
Technické parametry
Smlouva o uplatnění metodiky č. CM-9/2020 byla uzavřena 11. 11. 2020 s Lesy České republiky s. p., Hradec Králové, IČ: 42196451 zastoupenými Ing. Josefem Vojáčkem, generálním ředitelem, zastoupeným JUDr. Pavlem Krpatou, správním ředitelem, e-mail: pavel.krpata@lesycr.cz, tel. č. 956 999 554
Ekonomické parametry
Předpokládané přínosy jsou v možnosti uplatnit uvedené metodické postupy nejen při posuzování fyziologického stavu topolů vyskytujících se v limitujících podmínkách, ale i u jiných druhů listnatých dřevin s využitím vybraných genů charakterizujících jejich stav. Stanovení relativní exprese hladin sledovaných genů je velmi využívanou metodou pro získání informace o konkrétním stavu jedince a vlivu abiotických případně biotických podmínek na něj.
Označení certifikačního orgánu
Ministerstvo zemědělství, Těšnov 17, Praha 1
Datum certifikace
—
Způsoby využití výsledku
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů