Hodnocení postupů pro zvýšení efektivity detekce nízkých počtů bakterií ve vzorcích vod metodou polymerázové řetězové reakce

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020711%3A_____%2F11%3A00003010" target="_blank" >RIV/00020711:_____/11:00003010 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vuv.cz/fileadmin/user_upload/pdf/vtei/2011/vtei_2-2011.pdf" target="_blank" >http://www.vuv.cz/fileadmin/user_upload/pdf/vtei/2011/vtei_2-2011.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Hodnocení postupů pro zvýšení efektivity detekce nízkých počtů bakterií ve vzorcích vod metodou polymerázové řetězové reakce

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem naší práce bylo otestovat možnost zvýšení výtěžnosti polymerázové řetězové reakce (PCR), která je velmi perspektivní metodou pro detekci bakterií přímo ze vzorků vod, optimalizací jejích nejvýznamnějších kroků, tj. extrakce buněk, izolace a vlastníamplifikace DNA. V rámci práce byly otestovány metody izolace DNA, metody zakoncentrování buněk ze vzorků a PCR pro stanovení enterokoků z vod pro druhově specifický gen tuf. Vyhodnocení výsledků testovaných metod a postupů ukázalo, že kombinací vhodných postupů a jejich pečlivým provedením, zaměřeným na snížení ztrát DNA v reakční směsi, lze zvýšit efektivitu detekce při použití metody PCR pro vzorky s nízkým obsahem bakterií.

Název v anglickém jazyce

Evaluation of procedures for effectiveness increasing of detection of low bacteria counts in water samples using polymerase chain reaction

Popis výsledku anglicky

The aim of our study was to test the possibility of yield increasing of polymerase chain reaction (PCR), which seems to be very perspective method for detection of bacteria directly in water samples. It was achieved by optimisation of the most significant steps, i.e. cells extraction, isolation and amplification of DNA. The DNA isolation methods, methods for cells concentration from water samples and PCR for detection of enterococci from water were tested for species-specific genus tuf. The results evaluation of tested methods and procedures showed that by combination of suitable procedures and their accurate realisation, focused on decrease of DNA losses in reaction mixture, the effectiveness of PCR detection of bacteria in samples with small bacterial density can be increased.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

VTEI

ISSN

0322-8916

e-ISSN

—

Svazek periodika

53

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

11-14

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—