Detekce SARS-CoV-2 v odpadních vodách na ČOV v ČR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020711%3A_____%2F22%3A10154815" target="_blank" >RIV/00020711:_____/22:10154815 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://ywp.cz/cs/aktualita/3-rocnik-konference-mlada-voda-brehy-mele-48YkzS" target="_blank" >https://ywp.cz/cs/aktualita/3-rocnik-konference-mlada-voda-brehy-mele-48YkzS</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Detekce SARS-CoV-2 v odpadních vodách na ČOV v ČR

Popis výsledku v původním jazyce

Prezentovaná studie využívá faktu, že veškeré látky včetně genových fragmentů virové RNA SARS-CoV-2 vylučované močí a výkaly jedinců se dostávají do odpadních vod, kde následně tvoří skupinové diagnostické médium. Analýza odpadních vod dokáže zjistit přítomnost těchto specifických látek nebo markerů v populaci. Na základě nového epidemiologického přístupu k odpadním vodám (WBE, z angl. &quot;Wastewater-Based Epidemiology&quot;) lze použít detekci RNA viru SARS-CoV-2 v podobě biomarkeru výskytu onemocnění covid-19 v odpadních vodách jako nástroje vytvoření systému včasného varování pro predikci nástupu další vlny epidemie anebo vzniku nových infekčních ohnisek.Cílem práce byla detekce SARS-CoV-2 ve vzorcích odpadních vod ve vybraných ČOV v ČR, korelace jejího výskytu s epidemiologickými údaji o počtech pozitivně testovaných jedinců. Dále posouzení možnosti systematického monitoringu odpadních vod v ČR pro účely detekce SARS-CoV-2 a uplatnění této metody jako nezávislého nástroje stanovení virové nálože v populaci. Současně byl prováděn výzkum a vývoj analytických metod detekce virů v odpadních vodách a optimalizace postupů pro odběry vzorků odpadních vod (homogenita a stabilizace vzorků), které jsou nedílnou součástí dané analýzy.Vzorky byly odebírány na nátocích 66 ČOV v ČR. Genové fragmenty virové RNA SARS-CoV-2 byly detekovány metodou kvantitativní polymerázové řetězové reakce (RT-qPCR).Naše výsledky prokázaly, že množství SARS-CoV-2 v odpadních vodách koreluje s počty pozitivně testovaných osob. Na základě výsledků byly zachyceny jednotlivé vlny epidemie a je ověřována možnost predikce vývoje. Byla prokázána vysoká citlivost metody, která zachytila v odpadních vodách i jednotky pozitivně testovaných osob.Použití WBE přístupu se, pro daný účel, ukázalo jako velmi perspektivní.

Název v anglickém jazyce

Detection of SARS-CoV-2 in wastewater at a WWTP in the Czech Republic

Popis výsledku anglicky

The presented study uses the fact that all substances, including gene fragments of viral RNA SARS-CoV-2 excreted in the urine and feces of individuals, enter the wastewater, where they subsequently form a group diagnostic medium. Wastewater analysis can detect the presence of these specific substances or markers in the population. Based on the new epidemiologic approach to wastewater (WBE, from the English &quot;Wastewater-Based Epidemiology&quot;), the detection of SARS-CoV-2 virus RNA in the form of a biomarker of the occurrence of covid-19 disease in wastewater can be used as a tool to create an early warning system for prediction the onset of another epidemic wave or the emergence of new infectious outbreaks.The aim of the work was the detection of SARS-CoV-2 in wastewater samples in selected WWTPs in the Czech Republic, correlation of its occurrence with epidemiological data on the number of positively tested individuals. Furthermore, an assessment of the possibility of systematic monitoring of wastewater in the Czech Republic for the purpose of SARS-CoV-2 detection and the application of this method as an independent tool for determining the viral load in the population. At the same time, research and development of analytical methods for the detection of viruses in wastewater and optimization of wastewater sampling procedures (homogeneity and stabilization of samples) were carried out, which are an integral part of the given analysis.Samples were taken at the inlets of 66 WWTPs in the Czech Republic. SARS-CoV-2 viral RNA gene fragments were detected by quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR).Our results showed that the amount of SARS-CoV-2 in wastewater correlates with the number of people tested positive. Based on the results, the individual waves of the epidemic were captured and the possibility of predicting the development is verified. The high sensitivity of the method was demonstrated, as it caught even units of positively tested persons in the wastewater.The use of the WBE approach, for the given purpose, turned out to be very promising.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/VI04000017" target="_blank" >VI04000017: Využití monitoringu odpadních vod jako nástroje včasného varování před vznikem epidemiologické situace</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů