Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00023001%3A_____%2F14%3A00059159" target="_blank" >RIV/00023001:_____/14:00059159 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tan.12356/pdf" target="_blank" >http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tan.12356/pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/tan.12356" target="_blank" >10.1111/tan.12356</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas

  • Popis výsledku v původním jazyce

    In this review, we present for the first time an integrated version of the GENE[RATE] computer tools which have been developed during the last 5 years to analyse human leukocyte antigen (HLA) data in human populations, as well as the results of their application to a large dataset of 145 HLA-typed population samples from Europe and its two neighbouring areas, North Africa and West Asia, now forming part of the GENE[VA] database. All these computer tools and genetic data are, from now, publicly availablethrough a newly designed bioinformatics platform, HLA-net, here presented as a main achievement of the HLA-NET scientific programme. The GENE[RATE] pipeline offers user-friendly computer tools to estimate allele and haplotype frequencies, to test Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), selective neutrality and linkage disequilibrium, to recode HLA data, to convert file formats, to display population frequencies of chosen alleles and haplotypes in selected geographic regions, and to perform ge

  • Název v anglickém jazyce

    The HLA-net GENE[RATE] pipeline for effective HLA data analysis and its application to 145 population samples from Europe and neighbouring areas

  • Popis výsledku anglicky

    In this review, we present for the first time an integrated version of the GENE[RATE] computer tools which have been developed during the last 5 years to analyse human leukocyte antigen (HLA) data in human populations, as well as the results of their application to a large dataset of 145 HLA-typed population samples from Europe and its two neighbouring areas, North Africa and West Asia, now forming part of the GENE[VA] database. All these computer tools and genetic data are, from now, publicly availablethrough a newly designed bioinformatics platform, HLA-net, here presented as a main achievement of the HLA-NET scientific programme. The GENE[RATE] pipeline offers user-friendly computer tools to estimate allele and haplotype frequencies, to test Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), selective neutrality and linkage disequilibrium, to recode HLA data, to convert file formats, to display population frequencies of chosen alleles and haplotypes in selected geographic regions, and to perform ge

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EC - Imunologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Tissue Antigens

  • ISSN

    0001-2815

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    83

  • Číslo periodika v rámci svazku

    5

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    17

  • Strana od-do

    307-323

  • Kód UT WoS článku

    000334356100001

  • EID výsledku v databázi Scopus