Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00023736%3A_____%2F21%3A00013224" target="_blank" >RIV/00023736:_____/21:00013224 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/65269705:_____/21:00074218 RIV/00216224:14740/21:00120108

Výsledek na webu

<a href="https://doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210" target="_blank" >https://doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.plabm.2021.e00210" target="_blank" >10.1016/j.plabm.2021.e00210</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

Popis výsledku v původním jazyce

BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.

Název v anglickém jazyce

Digital PCR can provide improved BCR-ABL1 detection in chronic myeloid leukemia patients in deep molecular response and sensitivity of standard quantitative methods using EAC assays

Popis výsledku anglicky

BCR-ABL1 molecular detection using quantitative PCR (qPCR) methods is the golden standard of chronic myeloid leukemia (CML) monitoring. However, due to variable sensitivity of qPCR assays across laboratories, alternative methods are tested. Digital PCR (dPCR) has been suggested as a robust and reproducible option. Here we present a comparison of droplet dPCR with routinely used reverse-transcription qPCR (RT-qPCR) and automated GeneXpert systems. Detection limit of dPCR was above 3 BCR-ABL1 copies, although due to background amplification the resulting sensitivity was 0.01% BCR-ABL1 (MR4.0). Nevertheless, in comparison with GeneXpert, dPCR categorized more than 50% of the patients into different MR groups, showing a potential for improved BCR-ABL1 detection.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

30205 - Hematology

Projekt

<a href="/cs/project/NV17-30397A" target="_blank" >NV17-30397A: Mutační analýza primitivních buněčných populací u chronické myeloidní leukémie: za hranicí BCR-ABL1</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Practical laboratory medicine

ISSN

2352-5517

e-ISSN

—

Svazek periodika

25

Číslo periodika v rámci svazku

[May]

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

"art. no. e00210"

Kód UT WoS článku

000653682600011

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85102511335