Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F03%3A%23%23%23%23%23196" target="_blank" >RIV/00027006:_____/03:#####196 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00027006:_____/03:196

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů

Popis výsledku v původním jazyce

Studovali jsme možnost využití kvantitativní PCR v reálném čase (QRT PCR) pro sledování zrněn v expresi genů po působení stresorů. Jako modelová rostlina byl zvolen ječmen. V rámci modelového experimentu byl sledován vliv chladového stresu. Je známo, ženásledkem chladového stresu se zvyšuje produkce některých proteinů, které jsou označovány jako dehydriny. Nebyly zaznamenán délkový polymorfismus sledovaných amplikonů mezi 3 odrůdami. V rámci studie jsme optimalizovali jednotlivé kroky QRT PCR analýzy.Jako nejvhodnější z testovaných postupů izolace RNA nejlepší výsledky poskytl protokol s využitím sady Quiagen. Použití oligodT zajistilo efektivní průběh reverzní transkripce. Výsledek QRT PCR byl závislý na výchozí koncentraci RNA v reakční směsi. V rozsahu experimentálního uspořádání bylo možné využít jako referenční gen ubiquitin. Za testovaných podmínek chladového stresu jsme nezjistili změny a rozdíly v expresi genů Dhn 6, 7, 9, 11. Změny v expresi genů Dhn 5 a 8 byly zaznamenány. QR

Název v anglickém jazyce

Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment

Popis výsledku anglicky

We studied a possibility to use real-time PCr for gene expression profilling. Expression of Dhn gene in barley as a response to cold stress was taken as a model. Lengt polymorphism of the gene was not recorded. By the use of optimised protocol we showedchanges in Dhn 6, 7, 9, 11 expression.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QC1336" target="_blank" >QC1336: Vývoj nových metod pro monitorování diverzity a hodnocení genových zdrojů a zhodnocení jejich potenciálu.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Vliv abiotických a biotických stresorů na vlastnosti rostlin

ISBN

80-86555-27-5

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

90-93

Název nakladatele

Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha

Místo vydání

Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha

Místo konání akce

Výzkumný ústav rostlinné výroby, Praha

Datum konání akce

8. 10. 2003

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—