Využití rodokmenová analýza pro tvorbu core kolekce ozimé pšenice
Popis výsledku
Byla ověřena použitelnost a správnost využití rodokmenového přístupu pro hodnocení genetické diversity. Tento postup předpokládá porovnání odhadů podobnosti odrůd založených na využití genetických markerů s výsledky analýzy pedigree. Byla vytvořena metoda pro použití analýzy původů při tvorbě core kolekcí. Použitelnost metody byla ověřena výpočtem Shanonova indexu diversity a porovnáním zjištěných hodnot; dále korelací mezi mezi přínosy jednotlivých předků. Byla vytvořena core kolekce, která zahrnuje 25% položek z celkové české kolekce ozimé pšenice (Triticum aestivun L.) . Tato kolekce reprezentuje 70 - 76% diversity v rámci vypočtených skupin. Přitom nebyl zjištěn pokles diversity mezi skupinami. The approach implies a comparison of the estimates ofsimilarity based on genetic markers and coefficients of parentage. A method of the application of the genealogical approach to the formation of the care collection has been developed. The adequacy of the core has been estimated using Shan
Klíčová slova
Winter wheatpedigree analysesShannon?s diversity indexcore collection
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Genealogical Approach to the Formation of the Winter Wheat Core Collection
Popis výsledku v původním jazyce
The correctness of the genealogical approach to the estimation of genetic diversity has been substantiated. The approach implies a comparison of the estimates of similarity based on genetic markers and coefficients of parentage. A method of the application of the genealogical approach to the formation of the care collection has been developed. The adequacy of the core has been estimated using Shannon?s diversity index adapted for genetic profiles and the correlation between the distributions of ancestors?conurbations. A core collection has been formed. This collection contains 25% of the accessions of the entire winter wheat (Triticum aestivun L.) collection from the Czech Gene bank and represents 70-76% of the within-cluster diversity. A decrease in between-cluster diversity has not been found in the core collection.
Název v anglickém jazyce
Genealogical Approach to the Formation of the Winter Wheat Core Collection
Popis výsledku anglicky
The correctness of the genealogical approach to the estimation of genetic diversity has been substantiated. The approach implies a comparison of the estimates of similarity based on genetic markers and coefficients of parentage. A method of the application of the genealogical approach to the formation of the care collection has been developed. The adequacy of the core has been estimated using Shannon?s diversity index adapted for genetic profiles and the correlation between the distributions of ancestors?conurbations. A core collection has been formed. This collection contains 25% of the accessions of the entire winter wheat (Triticum aestivun L.) collection from the Czech Gene bank and represents 70-76% of the within-cluster diversity. A decrease in between-cluster diversity has not been found in the core collection.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GE - Šlechtění rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
QC1345: Zvýšení uživatelské hodnoty genofondů pšenice a ječmene a efektivity práce s kolekcemi
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2003
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Russian Journal of Genetics
ISSN
1022-7954
e-ISSN
—
Svazek periodika
39
Číslo periodika v rámci svazku
8
Stát vydavatele periodika
RU - Ruská federace
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
1091-1098
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
GE - Šlechtění rostlin
Rok uplatnění
2003