Stanovení genetické diverzity evropských izolátů rzi ovesné (Puccinia coronata f. sp. avenae) pomocí AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F06%3A1287" target="_blank" >RIV/00027006:_____/06:1287 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Stanovení genetické diverzity evropských izolátů rzi ovesné (Puccinia coronata f. sp. avenae) pomocí AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

Popis výsledku v původním jazyce

Rez ovesná (Puccinia coronata f. sp. avenae) je považována za jednu z nejvýznamnějších listových houbových chorob každoročně napadající porosty ovsa (Avena sp.) ve většině světových oblastech jeho pěstování. Detailní poznání patogena je důležitou součástí šlechtitelských programů na rezistenci k obilním rzím. Celkem 40 monopustulových izolátů rzi ovesné, pocházejících z rozdílných geografických oblastí Evropy a Středního východu, bylo charakterizováno pomocí fytopatologické analýzy a molekulárně biologické metody AFLP. Byla zjištěna vysoká úroveň variability v rozsahu a kombinacích virulence u rzi ovesné, většina patotypů byla zjištěna pouze v individuálních případech. AFLP analýza byla provedena dle protokolu firmy Applied Biosystems. Každý z 12 primerových párů použitých v selektivní amplifikaci detekoval 13-58 DNA fragmentů v rozmezí 50-495 bp. Celkově bylo detekováno 501 polymorfních fragmentů u všech izolátů, což odpovídá průměrnému počtu 41 polymorfních fragmentů na primerový pár

Název v anglickém jazyce

Genetic diversity of the European oat crown rust (Puccinia coronata f. sp. avenae) isolates determined by AFLP analysis

Popis výsledku anglicky

Oat crown rust, caused by Puccinia coronata f. sp. avenae, has been considered one of the most important fungal diseases of cultivated oat worldwide. The detailed knowledge of pathogen is an integral part of rust resistance breeding programmes. Totally 40 monopustule isolates of oat crown rust collected in different geographical European and Middle East areas were characterised by means of plant pathologic and molecular analyses. High variability in virulence was found, majority of pathotypes were identified only in individual cases. AFLP analysis was carried out according to the AFLPTM Plant Mapping protocol (Applied Biosystems). Twelve primer pairs were used for selective amplification. For each primer pair, 13-58 DNA fragments, ranging in size from50 to 495 bp were detected. A total of 501 AFLP polymorphic fragments were scored with all the isolates; it corresponds to an average of 41 polymorphic bands per primer combination. Dendrogram produced by the analysis of the genetic dista

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/1G58083" target="_blank" >1G58083: Zdroje rezistence a inovace metod selekce pro šlechtění na komplexní odolnost k hlavním listovým chorobám pšenice a ovsa.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník příspěvků z XVII. české a slovenské konference o ochraně rostlin

ISBN

80-213-1564-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

243-247

Název nakladatele

Česká zemědělská univerzita Praha

Místo vydání

ČZU Praha

Místo konání akce

Česká zemědělská univerzita Praha

Datum konání akce

12. 9. 2006

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—