Možnosti stanovení Fusárií pomocí DNA čipu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F09%3A00000871" target="_blank" >RIV/00027006:_____/09:00000871 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Možnosti stanovení Fusárií pomocí DNA čipu

Popis výsledku v původním jazyce

Byl připraven DNA čip pro detekci Fusarium spp., produkujících mykotoxiny trichothecen a moniliformin. Čip byl testován na ověřených sbírkových kmenech F. culmorum, F. poae, F. graminerarum a na vzorcích zrn pšenice napadených Fusariem. DNA čip tvoří oligonukleotidové DNA sondy modifikované na 5´konci primární aminoskupinou, ketré jsou imobilizované na aldehydovaném povrchu skla. Jako templátová DNA pro hybridizaci na DNA čipu byly použity PCR produkty variabilní části Translačního elongačního faktoru 1-alfa (700 bp). Templátová DNA byla značena fluorescenční barvou Cy5 (Alexa5) nebo Cy3 (Alexa3) s pomocí značící PCR nebo dodatečným naznačením PCR produktu s použitím kitu BioPrime Total Genomic Labeling System. Získané výsledky ukazují, že DNA čip je vhodný pro detekci F. graminearum, F. culmorum a F. poae.

Název v anglickém jazyce

DNA chip for detection of Fusariom spp.

Popis výsledku anglicky

DNA chip for detection of Fusarium spp. producing mycotoxins trichothecene and moniliformin was prepared. DNA chip was tested on verified strains of F. culmorum, F. poae, F. graminerarum and on samples of wheat grains contaminated by Fusarium spp. DNA chip consist of oligonucleotide probes modified on 5´end by primary amino group, which are immobilized on aldehyde surface of glass slide. As a template DNA were used PCR products of variable part of translation elongation factor 1 alpha (700 bp) for hybridization on the DNA chip. Template DNA was labeled by Cy5 (Alexa5) or Cy3 (Alexa3) in labeling PCR or by ex-post labeling of PCR products using BioPrime Total Genomic Labeling System. Our results indicate, that DNA chip is suitable for detection of F. graminearum, F. culmorum and F. poae.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/1G46068" target="_blank" >1G46068: Vývoj a aplikace technologie DNA array pro vysoce kapacitní systém identifikace genů, genotypů a produktů pro potřeby jejich charakterizace a kontrolu trhu.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Aktuální otázky stanovení specifické DNA: možnosti efektivního využití při kontrole v zemědělství a potravinářství

ISBN

978-80-87011-59-1

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

—

Název nakladatele

VÚRV, v.v.i.

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Praha

Datum konání akce

1. 1. 2009

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—