Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F14%3A00002970" target="_blank" >RIV/00027006:_____/14:00002970 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-014-2031-5" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s00705-014-2031-5</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-014-2031-5" target="_blank" >10.1007/s00705-014-2031-5</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines

Popis výsledku v původním jazyce

Analysis of complete genome sequences of three Slovak isolates of grapevine Pinot gris virus (GPGV) showed their low heterogeneity (reaching 1.7 %) and a close relationship to the Italian NC_015782 isolate (4.2-4.5 % divergence). Comparison of Slovak andItalian isolates revealed an unusual accumulation of 21 indel mutations in ORF1, resulting in a localized high divergence in the encoded amino acid sequences. An elevated divergence in the 5' extremity of the GPGV genomes is suggestive of a recombination between Slovak isolates and grapevine berry inner necrosis virus. RT-PCR allowed the frequent detection of closely related GPGV isolates in grapevines from Slovakia and the Czech Republic.

Název v anglickém jazyce

Molecular characterization of divergent grapevine Pinot gris virus isolates and their detection in Slovak and Czech grapevines

Popis výsledku anglicky

Analysis of complete genome sequences of three Slovak isolates of grapevine Pinot gris virus (GPGV) showed their low heterogeneity (reaching 1.7 %) and a close relationship to the Italian NC_015782 isolate (4.2-4.5 % divergence). Comparison of Slovak andItalian isolates revealed an unusual accumulation of 21 indel mutations in ORF1, resulting in a localized high divergence in the encoded amino acid sequences. An elevated divergence in the 5' extremity of the GPGV genomes is suggestive of a recombination between Slovak isolates and grapevine berry inner necrosis virus. RT-PCR allowed the frequent detection of closely related GPGV isolates in grapevines from Slovakia and the Czech Republic.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Archives of Virology

ISSN

0304-8608

e-ISSN

—

Svazek periodika

159

Číslo periodika v rámci svazku

8

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

2103-2107

Kód UT WoS článku

000339888300024

EID výsledku v databázi Scopus

—