Využití kombinace laboratorních metod pro včasnou diagnostiku hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F17%3A00003862" target="_blank" >RIV/00027006:_____/17:00003862 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN%20978-80-7427-212-7.pdf" target="_blank" >https://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN%20978-80-7427-212-7.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití kombinace laboratorních metod pro včasnou diagnostiku hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius)

Popis výsledku v původním jazyce

Prokázání hniloby včelího plodu (původce Melissococcus plutonius) je ve srovnání s morem včelího plodu (původce Paenibacillus larvae) běžnými kultivačními metodami značně obtížnější. V současné době nejsou kultivační postupy této anaerobní grampozitivní bakterie dostatečně selektivní. Tento problém řeší předložená metodika, která zahrnuje kromě kultivačních postupů také metody molekulární biologie: polymerázovou řetězovou reakci (PCR) a vysokokapacitní technologie sekvenování nové generace. Molekulárně genetické metody umožňují spolehlivou detekci patogena v různých vývojových stádiích včel, a to jak v plodu, tak v dospělých včelách. Takovou analýzou dospělých včel je možno predikovat přenos infekce mezi včelstvy, který hrozí zejména ze zalétávání jednotlivých včel do jiných než domovských úlů. Výhodou použití vysokokapacitní sekvenační technologie je také možnost určení vlivu infekce M. plutonius na symbiotické bakterie včely medonosné jako faktoru imunity včelstva. Text zahrnuje podrobně popsané postupy laboratorního zpracování vzorků a bioinformatická zpracování a interpretaci dat. Metodika je využitelná pro potřeby laboratoří zabývající se diagnostikou onemocnění včel, je vhodná i pro potřeby výzkumné či didaktické.

Název v anglickém jazyce

Utilization of laboratory methods combination for early diagnostics of European foulbrood (causative agent Melissococcus plutonius)

Popis výsledku anglicky

Compared to the American foulbrood (AFB; causative agent Paenibacillus larvae), the determination of European foulbrood (EFB; causative agent Melissococcus plutonius) is substantially difficult. The selectivity of current cultivation methods of this anaerobic Gram-positive bacterium is low. Apart from cultivation methods, the present methodology consists of polymerase chain reaction (PCR) techniques and the high-throughput technology of next-generation sequencing. The molecular genetics methods enable reliable detection of the pathogen in different developmental stages of honeybees, including brood and adult bees, too. The analysis of adult bees also predicts the possibility of infection transmission to other colonies and apiaries; the drifting behavior of bees poses a substantial risk of disease transmission. High-throughput technology advantage is the opportunity to determine the M. plutonius infection impact on symbionts that represent the substantial part of honeybee colony immunity. The methodology includes laboratory sample processing of bees described in detail, bioinformatics processing and data interpretations. This methodology is useful in laboratories for honeybee diseases analyzes, and moreover it is suitable for research and didactic purposes, too.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1310085" target="_blank" >QJ1310085: Nové metody pro komplexní diagnostiku zdravotního stavu včelstev Apis mellifera pro prevenci chorob a zvýšení jejich fitness</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

ISBN 978-80-7427-212-7

Číslo předpisu

21222/2017-MZE-16232

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. 21222/2017-MZE-16232 o uznání certifikované metodiky bylo vystaveno Ministerstvem zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství dne 30.6.2017. Smlouva o uplatnění certifikované metodiky č. 8/2016 uzavřená dne 31.5.2017 mezi stranami - Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Drnovská 507, 161 06 Praha 6, IČ00027006, DIČ: CZ00027006 (poskytovatel) a Českým svazem včelařů, z.s., Křemencova 8, 110 00 Praha 1, IČ: 00443239, DIČ: CZ00443239, zastoupený předsedkyní Mgr. Jarmilou Machovou a tajemníkem Ing. Petrem Šerákem, (uživatel). Statutární zástupce za VÚRV, v.v.i.: Dr. Ing. Pavel Čermák, ředitel Kontaktní osoba za VÚRV,v.v.i.: RNDr. Tomáš Erban, Ph.D., tel. 233022411, e-mail: erban@vurv.cz ISBN 978-80-7427-212-7 (Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.) ISBN 978-80-87196-23-6 (Výzkumný ústav včelařský,ms.r.o.

Ekonomické parametry

Cenové nároky na vzorek: - extrakce DNA – 100 Kč - PCR s použitím detekčních primerů pro M. plutonius a eubakteriálních primerů – 40 Kč - sekvenování pomocí metody sekvenování nové generace – lze využít sekvenace V4 oblasti genu 16S rRNA za 600 Kč nebo sekvenace V1 až V3 oblasti genu 16S rRNA za 2 200 Kč - celkové náklady na vzorek při použití metody sekvenace nové generace se mohou v současnosti pohybovat dle zvolené metody a započtení práce od cca 1 000 Kč do 2 600 Kč bez DPH. - celkové náklady na přímou PCR analýzu jednoho vzorku se mohou pohybovat po započtení práce v ceně 500 až 1 000 Kč - stanovení M. plutonius pomocí mikrobiologických metod je cca 500 Kč

Označení certifikačního orgánu

Ministerstvo zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství, Těšnov 65/17, 110 00 Praha 1

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel