Reakční směs pro kvantifikaci karanténního RNA viru kroužkovitosti tabáku v rajčatech (Solanum lycopersicum)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F20%3A10149288" target="_blank" >RIV/00027006:_____/20:10149288 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Reakční směs pro kvantifikaci karanténního RNA viru kroužkovitosti tabáku v rajčatech (Solanum lycopersicum)
Popis výsledku v původním jazyce
Reakční směs pro současnou detekci a kvantifikaci RNA TRSV - viru kroužkovitosti tabáku za pomoci dvou referenčních genů rajčete jakožto normalizačních faktorů pomocí polymerázové řetězové reakce v reálném čase vyznačující se tím, že je současně tvořená třemi reakčními směsmi, obsahující každá 4 µl vzorku testované cDNA; SYBR Green PCR Master Mix, který obsahuje 0,25 µl DNA polymerázy o koncentraci 5 U/µl, 5 µl směsi oligonukleotidů o koncentraci 2,5 mM, 5 µl pufru obsahujícího MgCl2 o konečné koncentraci 5,5mM; 1 µL specifických primerů o původní koncentraci 10μM pro kvantifikaci mRNA rajčete EF1 - elongační faktor 1α, CAC - subjednotka adaptoru klatrinového komplexu a detekci a kvantifikaci TRSV, konkrétně v jedné reakci 0,5 µl primeru EF1-R, tvořeného sekvencí 5'-ACCGGCATCACCATTCTTCA-3', 0,5 µl primeru EF1-F tvořeného sekvencí 5'-GATTGACAGACGTTCTGGTAAGGA-3', v druhé reakci 0,5 µl primeru CAC-R tvořeného sekvencí 5'-ATTGGTGGAAAGTAACATCATCG-3', 0,5 µl primeru CAC-F tvořeného sekvencí 5'-CCTCCGTTGTGATGTAACTGG-3', v třetí reakci 0,5 µl primeru TRSV-R tvořeného sekvencí 5'-GCACCAGCGTAAGAACCCAA-3', 0,5 µl primeru TRSV-F tvořeného sekvencí 5'-GGGGTGCTTACTGGCAAGG-3'; a destilovanou vodou doplňující každou reakční směs do konečného objemu 25 µl.
Název v anglickém jazyce
The reaction mixture for quantification of quarantine RNA of Tobacco ringspot virus in tomato (Solanum lycopersicum)
Popis výsledku anglicky
Reaction mixture for the simultaneous detection and quantification of TRSV RNA using two reference tomato genes as normalizing factors by real-time qPCR, characterized in that it consists of three reaction mixtures simultaneously, each containing 4 µl of test cDNA sample; SYBR Green PCR Master Mix, which contains 0.25 µl of DNA polymerase at a concentration of 5 U / µl, 5 µl of a mixture of oligonucleotides at a concentration of 2.5 mM, 5 µl of buffer containing MgCl2 at a final concentration of 5.5 mM; 1 µL of specific primers with an initial concentration of 10μM for quantification of tomato mRNA EF1 - elongation factor 1α, CAC - clathrin complex adapter subunit and detection and quantification of TRSV, specifically in one reaction 0.5 µl of primer EF1-R, consisting of 5'-ACCGGCATCACCATTCTTCA- 3 ', 0.5 µl of primer EF1-F consisting of the sequence 5'-GATTGACAGACGTTCTGGTAAGGA-3', in the second reaction 0.5 µl of primer CAC-R consisting of the sequence 5'-ATTGGTGGAAAGTAACATCATCG-3 ', 0.5 µl of primer CAC-F consisting of the sequence 5'-CCTCCGTTGTGATGTAACTGG-3 ', in the third reaction 0.5 µl of the primer TRSV-R consisting of the sequence 5'-GCACCAGCGTAAGAACCCAA-3', 0.5 µl of the primer TRSV-F consisting of the sequence 5'-GGGGTGCTTACTGGCAAG; and distilled water making up each reaction mixture to a final volume of 25 µl.
Klasifikace
Druh
F<sub>uzit</sub> - Užitný vzor
CEP obor
—
OECD FORD obor
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LTC18001" target="_blank" >LTC18001: Umlčování genů rajčete pomocí RNA interference proti karanténnímu patogenu viru kroužkovitosti tabáku (TRSV)</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Číslo patentu nebo vzoru
34530
Vydavatel
CZ001 -
Název vydavatele
Industrial Property Office
Místo vydání
Prague
Stát vydání
CZ - Česká republika
Datum přijetí
—
Název vlastníka
Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Způsob využití
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel
Druh možnosti využití
N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)