Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Molecular diversity of barley yellow dwarf virus-PAV from China and the Czech Republic

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F20%3A10149542" target="_blank" >RIV/00027006:_____/20:10149542 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311920632415/pdf?md5=c5843514442c01d67549d71dd89bf3ea&pid=1-s2.0-S2095311920632415-main.pdf" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311920632415/pdf?md5=c5843514442c01d67549d71dd89bf3ea&pid=1-s2.0-S2095311920632415-main.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/S2095-3119(20)63241-5" target="_blank" >10.1016/S2095-3119(20)63241-5</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Molecular diversity of barley yellow dwarf virus-PAV from China and the Czech Republic

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Wheat yellow dwarf disease (BYD), caused by different species of barley/cereal yellow dwarf viruses (B/CYDVs), is one of the most serious cereal diseases in China and the Czech Republic. Because genetic diversity of the virus directly influences disease epidemiology, the molecular diversity and population structure of 24 Chinese isolates and 16 the Czech Republic isolates of BYDV-PAV from different regions in two countries were analyzed by sequencing their coat protein (CP) and readthrough protein (RTP) domain (RTD) genes and comparing the sequences with six CP and 16 RTP sequences of BYDV-PAV isolates from the NCBI database based on nucleotide identity position, phylogenetic analysis and nucleotide diversity. Nucleotide identities between the Chinese and the Czech Republic isolates for the CP were 76.6-99.4%, 73.9-89.1% for RTD (ORF5), respectively. The Chinese and the other country isolates showed 74.7-99.2% nucleotide identity for RTP (ORF3+ORF5). Phylogenetic analysis of CP sequences showed that 20 Chinese isolates clustered in the same Glade, but the other four Chinese isolates clustered in another clade with the isolates from the Czech Republic and other counties. The population of BYDV-PAV in China had greater nucleotide variability and was more divergent than that in the Czech Republic. Geographical and ecological factors but not hosts might contribute to the population differences in the two countries.

  • Název v anglickém jazyce

    Molecular diversity of barley yellow dwarf virus-PAV from China and the Czech Republic

  • Popis výsledku anglicky

    Wheat yellow dwarf disease (BYD), caused by different species of barley/cereal yellow dwarf viruses (B/CYDVs), is one of the most serious cereal diseases in China and the Czech Republic. Because genetic diversity of the virus directly influences disease epidemiology, the molecular diversity and population structure of 24 Chinese isolates and 16 the Czech Republic isolates of BYDV-PAV from different regions in two countries were analyzed by sequencing their coat protein (CP) and readthrough protein (RTP) domain (RTD) genes and comparing the sequences with six CP and 16 RTP sequences of BYDV-PAV isolates from the NCBI database based on nucleotide identity position, phylogenetic analysis and nucleotide diversity. Nucleotide identities between the Chinese and the Czech Republic isolates for the CP were 76.6-99.4%, 73.9-89.1% for RTD (ORF5), respectively. The Chinese and the other country isolates showed 74.7-99.2% nucleotide identity for RTP (ORF3+ORF5). Phylogenetic analysis of CP sequences showed that 20 Chinese isolates clustered in the same Glade, but the other four Chinese isolates clustered in another clade with the isolates from the Czech Republic and other counties. The population of BYDV-PAV in China had greater nucleotide variability and was more divergent than that in the Czech Republic. Geographical and ecological factors but not hosts might contribute to the population differences in the two countries.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LTACH17010" target="_blank" >LTACH17010: Nové strategie integrované ochrany obilnin vůči virovým chorobám v České republice a Číně</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Science Direct

  • ISSN

    2095-3119

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    19

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    2736-2745

  • Kód UT WoS článku

    000579857800013

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85092502132