Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Comparative analysis of plastid genomes in the non-photosynthetic genus Thismia reveals ongoing gene set reduction

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F21%3A10174567" target="_blank" >RIV/00027006:_____/21:10174567 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61989592:15310/21:73608182

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.602598/pdf" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2021.602598/pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2021.602598" target="_blank" >10.3389/fpls.2021.602598</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Comparative analysis of plastid genomes in the non-photosynthetic genus Thismia reveals ongoing gene set reduction

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Heterotrophic plants provide intriguing examples of reductive evolution. This is especially evident in the reduction of their plastid genomes, which can potentially proceed toward complete genome loss. Several milestones at the beginning of this path of degradation have been described; however, little is known about the latest stages of plastome reduction. Here we analyze a diversity of plastid genomes in a set of closely related non-photosynthetic plants. We demonstrate how a gradual loss of genes shapes the miniaturized plastomes of these plants. The subject of our study, the genus Thismia, represents the mycoheterotrophic monocot family Thismiaceae, a group that may have experienced a very ancient (60-80 mya) transition to heterotrophy. In all 18 species examined, the plastome is reduced to 14-18 kb and is highly AT-biased. The most complete observed gene set includes accD, seven ribosomal protein genes, three rRNA, and two tRNA genes. Different clades of Thismia have undergone further gene loss (complete absence or pseudogenization) compared to this set: in particular, we report two independent losses of rps2 and rps18.

  • Název v anglickém jazyce

    Comparative analysis of plastid genomes in the non-photosynthetic genus Thismia reveals ongoing gene set reduction

  • Popis výsledku anglicky

    Heterotrophic plants provide intriguing examples of reductive evolution. This is especially evident in the reduction of their plastid genomes, which can potentially proceed toward complete genome loss. Several milestones at the beginning of this path of degradation have been described; however, little is known about the latest stages of plastome reduction. Here we analyze a diversity of plastid genomes in a set of closely related non-photosynthetic plants. We demonstrate how a gradual loss of genes shapes the miniaturized plastomes of these plants. The subject of our study, the genus Thismia, represents the mycoheterotrophic monocot family Thismiaceae, a group that may have experienced a very ancient (60-80 mya) transition to heterotrophy. In all 18 species examined, the plastome is reduced to 14-18 kb and is highly AT-biased. The most complete observed gene set includes accD, seven ribosomal protein genes, three rRNA, and two tRNA genes. Different clades of Thismia have undergone further gene loss (complete absence or pseudogenization) compared to this set: in particular, we report two independent losses of rps2 and rps18.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Frontiers in Plant Science

  • ISSN

    1664-462X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    12

  • Číslo periodika v rámci svazku

    MAR 16 2021

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    602598

  • Kód UT WoS článku

    000634889800001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85103489425