Kmen rodu Streptomyces 09VU38 produkující siderofory a IAA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F22%3A10175767" target="_blank" >RIV/00027006:_____/22:10175767 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Kmen rodu Streptomyces 09VU38 produkující siderofory a IAA

Popis výsledku v původním jazyce

Kmen Streptomyces sp. 09VU38 byl izolován z tuberosféry brambor pěstovaných v půdě svysokým výskytem obecné strupovitosti brambor. U kmene byla prokázána produkce auxinu a několika sideroforů, které byly určeny UPLC chromatografií s hmotnostní detekcí na základě molekulové hmotnosti, fragmentačního spektra a izotopových píků sideroforu s navázaným atomem železa. Pro podrobnější popis genové výbavy byla extrahována genomická DNA, sekvenován a sestaven genom kmene 09VU38. Celkem bylo identifikováno 31 biosyntetických shluků pro sekundární metabolity, 3 z nich byly na základě homologie identifikovány jako shluky pro biosyntézu sideroforů.

Název v anglickém jazyce

Strain of the genus Streptomyces 09VU38 producing siderophores and IAA

Popis výsledku anglicky

The strain Streptomyces sp. 09VU38 was isolated from the tuberosphere of potatoes grown in soil with high incidence of potato common scab. The strain was shown to produce auxin and several siderophores, which were determined by UPLC chromatography with mass detection based on the molecular weight, fragmentation spectrum and isotopic peaks of the siderophore with a bound iron atom. For a more detailed description of the gene pool, genomic DNA was extracted and the genome of strain 09VU38 was sequenced and assembled. A total of 31 biosynthetic clusters for secondary metabolites were found, 3 of which were identified by homology as clusters for siderophore biosynthesis.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QK1810370" target="_blank" >QK1810370: Postupy zajišťující rovnováhu živin v půdě pro ochranu brambor před chorobami a vlivem klimatických změn</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

FV-21-2022

Číselná identifikace

FV-21-2022

Technické parametry

Genom kmene Streptomyces sp. 09VU38 obsahuje 31 biosyntetických genových shluků pro syntézu sekundárních metabolitů včetně biologicky aktivních látek, z toho tří skupin sideroforů. V laboratorních podmínkách byla detekována produkce desferrioxaminu D2, E a G1, a kyseliny aspergillové, kromě sideroforů byla zjištěna i produkce auxinu. Kmen je využitelný jako inokulant podporující růst rostlin (PGPR).

Ekonomické parametry

Ekonomické benefity vyplývající z použití kmene jako inokulantu nelze zatím spolehlivě odhadnout. Lepší dostupnost železa v důsledku aktivity sideroforů a další podpůrné aktivity mohou vést ke zvýšení výnosu i omezení výskytu nemocí, např. u obecné strupovitosti brambor, jejíž závažnost se dostatečnou koncentrací dostupných forem železa snižuje, lze při průměrných výnosech a cenách a za pedpokladu zvýšení realizované ceny o 5% očekávat přínos pro pěstitele kolem 8 tis. Kč/ha. Přínos ošetření bude ovšem meziročně kolísat vzhledem k velké variabilitě výskytu nemoci v závislosti na počasí, zejména průběhu srážek, zároveň zatím nelze odhadnout náklady na ošetření.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00027006

Název vlastníka

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i., Česká zemědělská univerzita v Praze

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

O - Doposud nevyužívaný výsledek

Požadavek na licenční poplatek

—

Adresa www stránky s výsledkem

—