Simultaneous genotyping of 4 SNPs in promoter III of the ovine ACACA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F16%3AN0000029" target="_blank" >RIV/00027014:_____/16:N0000029 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vuzv.cz/sites/File/_privat/16028.pdf" target="_blank" >http://www.vuzv.cz/sites/File/_privat/16028.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.smallrumres.2016.03.027" target="_blank" >10.1016/j.smallrumres.2016.03.027</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Simultaneous genotyping of 4 SNPs in promoter III of the ovine ACACA

Popis výsledku v původním jazyce

biosynthesis of fatty acids in animal tissues. By sequencing analysis in promoter III of the ovine ACACA we identified 2 novel SNPs (A > G at 1168 bp and a T nucleotide insertion at 1182 bp) (GenBank accession number AJ292286). The novel variant (A > G at 1168 bp) was present in Cigaja, Sumavka, and Improved Valachian breed kept in the Czech Republic and T insertion at 1182 bp was present in the East Friesian breed. A protocol for rapid efficient simultaneous genotyping of ACACA variants using the primer extension method (PEA) was described, and a total of 171 animals belonging to sheep breeds: Cigaja (9), Sumavka (87), East Friesian (59) and Improved Valachian (16) were genotyped. Variant alleles are: A/G at 1168 bp, G/T at 1330 bp, C/G at 1138 bp and C/T at 1430 bp.The genotype combination AG/GT/CG/CC occurred in all 4 breeds kept in the Czech Republic with frequency of occurrence ranging from 15.25% to 44.45%. Allele frequencies of the Cigaja breed differ significantly from the other Czech sheep breeds

Název v anglickém jazyce

Simultaneous genotyping of 4 SNPs in promoter III of the ovine ACACA

Popis výsledku anglicky

biosynthesis of fatty acids in animal tissues. By sequencing analysis in promoter III of the ovine ACACA we identified 2 novel SNPs (A > G at 1168 bp and a T nucleotide insertion at 1182 bp) (GenBank accession number AJ292286). The novel variant (A > G at 1168 bp) was present in Cigaja, Sumavka, and Improved Valachian breed kept in the Czech Republic and T insertion at 1182 bp was present in the East Friesian breed. A protocol for rapid efficient simultaneous genotyping of ACACA variants using the primer extension method (PEA) was described, and a total of 171 animals belonging to sheep breeds: Cigaja (9), Sumavka (87), East Friesian (59) and Improved Valachian (16) were genotyped. Variant alleles are: A/G at 1168 bp, G/T at 1330 bp, C/G at 1138 bp and C/T at 1430 bp.The genotype combination AG/GT/CG/CC occurred in all 4 breeds kept in the Czech Republic with frequency of occurrence ranging from 15.25% to 44.45%. Allele frequencies of the Cigaja breed differ significantly from the other Czech sheep breeds

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1310107" target="_blank" >QJ1310107: Vliv genetického polymorfizmu lipogenických enzymů na složení mléčného tuku a obsah mastných kyselin v mléce malých přežvýkavců (kozy a ovce).</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Small Ruminant Research

ISSN

0921-4488

e-ISSN

—

Svazek periodika

138

Číslo periodika v rámci svazku

May

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

25-30

Kód UT WoS článku

000376543100004

EID výsledku v databázi Scopus

—