Spolehlivost genomických plemenných hodnot pro znaky zdraví u holštýnských dojnic

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F21%3AN0000027" target="_blank" >RIV/00027014:_____/21:N0000027 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vuzv.cz/_privat/21025.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/21025.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Spolehlivost genomických plemenných hodnot pro znaky zdraví u holštýnských dojnic

Popis výsledku v původním jazyce

Článek se zabývá spolehlivosti plemenných hodnot pro znaky zdraví vemene a paznehtů u holštýnského skotu. Byl proveden odhad plemenných hodnot a jejich spolehlivostí pro klinickou mastitidu, infekční nemoci paznehtů, neinfekční nemoci paznehtů, nemoci paznehtů včetně kulhání a nemoci paznehtů a kulhání samostatně. K vyhodnocení byl použit jednoznakový lineární animal model s opakovatelností. Nejvíce krav bylo použito pro odhad plemenných hodnot pro nemoci paznehtů včetně kulhání, 97 674 krav a nejméně pro neinfekční nemoci paznehtů 21 552. Pro odhad genomických plemenných hodnot byla použita jednokroková metoda genomického odhadu. Referenční populace byla v rozsahu 25 458 jedinců, býků 5 107, krav a jalovic 20 351. Konečný počet SNP byl 35 934. Laktační incidence byla nejvyšší u klinické mastitidy 23,55 %, nejnižší u kulhání 10,61 %. Koeficienty dědivosti byly v rozsahu 3,13 % u kulhání a 5,48 % u infekčních nemocí paznehtů. Použití genomického odhadu plemenné hodnoty se kladně projevilo na zvýšení spolehlivosti predikce plemenných hodnot u genotypovaných jedinců a to o 11 p. b. až 12 p. b.. Ukázalo se, že pokud je ve hře ještě další faktor působící zvýšení spolehlivosti, pak jeho vliv může převýšit vliv genomického odhadu u genotypovaného zvířete. U býků, otců dcer v datových souborech došlo v srovnání zejména s genomickými kravami a jalovicemi (nárůst spolehlivosti 12 p. b. až 13 p. b.) k nižšímu vzestupu spolehlivosti, v průměru pouze o 8 p. b.. Závěrem můžeme konstatovat, že použití genomické selekce je zásadní pro zvýšení spolehlivosti u mladých zvířat.

Název v anglickém jazyce

Reliability of genomic breeding values for health traits in Holstein dairy cows

Popis výsledku anglicky

The article deals with the reliability of udder breeding values and the foot and claw disorders in Holstein cattle. Breeding values and their reliability have been estimated for clinical mastitis, foot and claw infection diseases, non-infectious foot and claw disorders, foot and claw disorders, including lameness, and foot and claw disorders and lameness alone. A single- trait linear animal model with repeatability was used for evaluation. The most extensive dataset of 97,674 cows was used to estimate breeding values for foot and claw diseases, including lameness. The smallest dataset of 21,552 cows was used for non-infectious foot and claw disorders. A single-step genomic estimation method was used to estimate genomic breeding values. The reference population was in the range of 25,458 animals, bulls 5,107, cows and heifers 20 351. The final number of SNPs was 35,934. The lactation incidence was highest in clinical mastitis at 23.55 %, the lowest in lameness at 10.61 %. Heritabilities were in the range of 3.13 % for lameness and 5.48 % for infectious foot and claw diseases. The genomic evaluation positively increased the reliability of breeding values in genotyped individuals by 11 pp to 12 pp. If there is another factor at play to improve reliability, its effect may exceed the genotyped animal's genomic estimation effect. In bulls, sires with daughters in datasets, there was a lower increase in reliability than for genomic cows and heifers (increase from 12 pp to 13 pp), on average only by 8 pp. In conclusion, the use of genomic selection is essential to improve reliability in young animals.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40203 - Husbandry

Projekt

<a href="/cs/project/QK1810253" target="_blank" >QK1810253: Navýšení spolehlivosti celostátního genomického hodnocení dojeného skotu zařazením krav s domácí užitkovostí do genotypované referenční populace</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů