Genomické plemenné hodnoty pro klinickou mastitidu u českého holštýnského skotu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F21%3AN0000131" target="_blank" >RIV/00027014:_____/21:N0000131 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vuzv.cz/_privat/21126.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/21126.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Genomické plemenné hodnoty pro klinickou mastitidu u českého holštýnského skotu

Popis výsledku v původním jazyce

Genomické plemenné hodnot pro odolnost vůči klinické mastitidě (KM) byly odhadnuty při použití víceznakového modelu zahrnujícího znaky lineárního popisu vemene a počet somatických buněk. Bylo použito 13 794 holštýnských krav s plemenným zastoupením H100, které dosáhly 18 570 laktací s laktační incidencí klinické mastitidy za všechny podchycené laktace16,95 %. Všechny krávy měly první laktaci a případně druhou či třetí. Otelily se v letech 2017 až 2020. KM byla definována jako výskyt ano či ne za laktaci, počet somatických buněk jako průměrná hodnota za laktaci, znaky lineárního popisu: hloubka vemene, šířka vemene, závěsný vaz a celkové hodnocení exteriéru vemene v %. Byly odhadnuty genetické korelace mezi znaky a koeficienty dědivosti. Heritabilita KM byla 0,04, počtu somatických buněk logaritmovaných jako skore 0,11; šířky vemene 0,16; závěsného vazu 0,19; hloubky vemene 0,38 a hodnocení vemene 0,22. Genetická korelace mezi skóre somatických buněk a KM byla 0,93; genetické korelace KM a znaků lineárního popisu ležely v rozmezí 0,30 až 0,41. Jednokrokovou metodou genomického odhadu byly predikovány genomické plemenné hodnoty pro KM (GEPH_KM). Rodokmen zahrnoval 67 078 jedinců a 3 625 genomických býků. Výsledky ukázaly, že GEPH_KM umožnily rozlišit mezi zvířaty s vysokým a nízkým genetickým založením pro výskyt klinické mastitidy, a to s dostatečnou spolehlivostí. Pro genomické býky (3 625 zvířat) byla spolehlivost GEPH_KM v průměru 0,33; u krav se sledovaným fenotypem pro zdraví (13 794) pak 0,30. Pro genomické býky byl dolní kvartil GEPH_KM Q0,25 představován hodnotou -0.009 a horní kvartil GEPH_KM Q0,75 0,033; u krav se zdravotními údaji pak byly tyto hodnoty -0,013 a 0,036. Průměrné spolehlivosti odpovídající GEPH_KM do Q0,25 či nad hranici Q0,75 byly pro býky 0,35 a 0,30; pro krávy se zdravotními údaji 0,29 a 0,31. Při spolehlivosti GEPH_KM od 0,40 výše jsou pak GEPH_KM hodnoty Q0,25 -0.02 a Q0,75 0.03; pro krávy s fenotypy pak 0,01 a 0,06. Průměrné spolehlivosti GEPH_KM stoupají s rokem narození zvířat, aby maximum dosáhly u býků v 2013 (0,39; 0,45 genomičtí) a pro krávy v roce 2016 (0,31). Tento stoupající trend lze vysvětlit rostoucím množství informací, které byly využity pro odhad GEPH_KM u zvířat narozených v daném roce. Průměrné GEPH_KM u býků i byly vyšší než celkový průměr 0,01 mezi lety 1990 až 2000. Od roku 2000 pak na těchto datech pozorujeme pokles průměru GEPH_KM dnot býků daný nejspíše snahami šlechtitelů v celé populaci holštýnského plemene o zlepšení zdraví vemene.

Název v anglickém jazyce

Genomic breeding value for clinical mastitis in Czech Holstein cattle

Popis výsledku anglicky

Genomic breeding values for resistance to clinical mastitis (KM) (GEPH_KM) have been estimated using a multi-trait model including linear udder traits and somatic cell count. 13,794 Holstein cows were used, reaching 18,570 lactations with a lactation incidence of clinical mastitis for all lactations 16.95 %. All cows had the first lactation and possibly the second or third. They calved between 2017 and 2020. KM was defined as the incidence of yes or no during the lactation, the number of somatic cells as the average value for lactation. The linear type traits were udder depth, udder width, suspensory ligament and the subjective score for udder in %. Genetic correlations between traits and coefficients of heritability have been estimated. The heritability of KM was 0.04, a number of somatic cells expressed as score 0.11; udder width 0.16; suspensory ligament 0.19; udder depth 0.38 and udder 0.22. The genetic correlation between somatic cell score and KM was 0.93; the genetic correlations of KM and linear type traits ranged from 0.30 to 0.41. The single-step genomic method was used for the prediction of GEBV_KM. The pedigree included 67,078 individuals and 3,625 genomic bulls. The results showed that GEPH_KM distinguished between animals with high and low genetic backgrounds for KM with sufficient reliability. For genomic bulls (3,625 animals), reliability was on average 0.33; for cows with the health phenotype (13,794) 0.30. For genomic bulls, the lower quartile of GEPH_KM Q0.25 was represented by -0.009 and the upper quartile Q0.75 by 0.033; for cows with health phenotype, these values were -0.013 and 0.036. The average reliability corresponding to GEPH_KM up to Q0.25 or above the Q0.75 range was 0.35 and 0.30 for bulls, respectively. For cows with the health phenotype, the values for quartiles of reliabilities were 0.29 and 0.31, respectively. With the reliability of genomic breeding values from 0.40 above, Q0.25 GEPH_KM was -0.02, and Q0.75 0.03 for bulls; for cows with phenotypes, 0.01 and 0.06, respectively. Average reliability increases with the year of birth of the animals to reach the maximum for bulls in 2013 (0.39; 0.45 genomic bulls) and cows in 2016 (0.31). Information on the health phenotypes of cows is only available in recent years. Average GEPH_KM for both bulls and cows were higher than 0.01 between 1990 and 2000. Since 2000, a decrease in the average GEBV_KM of bulls was observed in our results.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

40203 - Husbandry

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910320" target="_blank" >QK1910320: Výzkum postupů šlechtění dojeného skotu s cílem zvýšit odolnost k nemocem využitím genomických plemenných hodnot, rozvoje systému sběru zdravotních dat a cílené genotypizace skotu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Výzkum v chovu skotu/Cattle Research

ISSN

0139-7265

e-ISSN

—

Svazek periodika

63

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

3-16

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—