Genomická asociační studie syndromu ovariálních cyst u holštýnského skotu
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F24%3A10006173" target="_blank" >RIV/00027014:_____/24:10006173 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Genomická asociační studie syndromu ovariálních cyst u holštýnského skotu
Popis výsledku v původním jazyce
Příspěvek popisuje postup při odhadu genetických parametrů a genomických plemenných hodnot (GPH) pro odolnost vůči výskytu ovariálních cyst u holštýnských dojnic. Genetické hodnocení bylo provedeno s využitím lineárního modelu jedince, rovnice zahrnovala pevné efekty pořadí, stáda, sezóny a roku otelení a náhodné efekty jedince, trvalého prostředí a reziduum. Do odhadu vstupovaly SNP genotypy 9 466 jedinců stanovené na Illumina 50K bovine bead chipu. Koeficient dědivosti dosáhl 2,5 %. Navazující vážená ssGWAS potvrdila vysoce polygenní založení ovariálních cyst, nicméně ukázala oblasti na BTA1, BTA12, BTA17, BTA19 a BTA29, které se mohou podílet na genetické determinaci této poruchy reprodukce.
Název v anglickém jazyce
Genome-wide association study of cystic ovaries in Holstein cattle
Popis výsledku anglicky
This paper describes the procedure for estimating genetic parameters and genomic breeding values (GBV) for resistance to ovarian cysts in Holstein dairy cows. The genetic evaluation was performed using a linear animal model, the model equation included fixed effects of parity, herd, season and year of calving and random effects of animal, permanent environment and residual. SNP genotypes of 9,466 individuals determined on a 50K Illumina bovine bead chip were entered into the estimation. The coefficient of heritability was 2.5%. Follow-up weighted ssGWAS confirmed a highly polygenic nature of ovarian cyst. However, we detected some regions on BTA1, BTA12, BTA17, BTA19, and BTA29 that might be involved in the genetic determination of this reproductive disorder.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
40203 - Husbandry
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QK1810253" target="_blank" >QK1810253: Navýšení spolehlivosti celostátního genomického hodnocení dojeného skotu zařazením krav s domácí užitkovostí do genotypované referenční populace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2024
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů