Detekce Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis v nepasterovaném mléce pomocí IS900 and F57 kompetitivní real time kvantitativní PCR a kultivace
Popis výsledku
Cílem studie bylo vyvinout duplexní real time qPCR systémy s interní amplifikační kontrolou specifické pro detekci Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP). Jako detekční cíle byly zvoleny pro kvalitativní analýzu multikopiový IS900 element a pro kvantifikační analýzu jednokopiový F57 element. Citlivost vyvinutých PCR systému a účinnost izolace byly stanoveny pomocí umělé kontaminace nepasterovaného mléka definovanou bakteriální suspenzí a zároveň pomocí plazmidových konstruktů. Vyvinuté systémy byly použity na analýzu.
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
On-farm spread of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in raw milk studied by IS900 and F57 competitive real time quantitative PCR and culture examination
Popis výsledku v původním jazyce
We developed two duplex real time qPCR systems specific for Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) detection. These real time qPCR assays amplify the multicopy element IS900 for qualitative analysis and the single copy element F57 for quantitative analysis. Both assays incorporate an internal amplification control. The sensitivity of the developed assays and isolation efficiency were demonstrated through the analysis of raw milk samples artificially contaminated with MAP cells and with plasmids containing cloned fragments of the targets. The developed assays for milk analysis were applied to samples from one farm with two faecal shedding cows. Three hundred and forty five individual milk samples were tested by real time qPCR assays and by cultivation. Hundred and eleven (32.5%) individual milk samples were positive by the real time qPCR, no milk sample was culture positive. The spread of MAP in individual, tank and bulk tank milk samples was also monitored.
Název v anglickém jazyce
On-farm spread of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in raw milk studied by IS900 and F57 competitive real time quantitative PCR and culture examination
Popis výsledku anglicky
We developed two duplex real time qPCR systems specific for Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) detection. These real time qPCR assays amplify the multicopy element IS900 for qualitative analysis and the single copy element F57 for quantitative analysis. Both assays incorporate an internal amplification control. The sensitivity of the developed assays and isolation efficiency were demonstrated through the analysis of raw milk samples artificially contaminated with MAP cells and with plasmids containing cloned fragments of the targets. The developed assays for milk analysis were applied to samples from one farm with two faecal shedding cows. Three hundred and forty five individual milk samples were tested by real time qPCR assays and by cultivation. Hundred and eleven (32.5%) individual milk samples were positive by the real time qPCR, no milk sample was culture positive. The spread of MAP in individual, tank and bulk tank milk samples was also monitored.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Food Microbiology
ISSN
0168-1605
e-ISSN
—
Svazek periodika
128
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000261668100010
EID výsledku v databázi Scopus
—
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
Rok uplatnění
2008