Mycobacterium avium subsp paratuberculosis viability determination using F57 quantitative PCR in combination with propidium monoazide treatment
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F10%3A%230000633" target="_blank" >RIV/00027162:_____/10:#0000633 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Mycobacterium avium subsp paratuberculosis viability determination using F57 quantitative PCR in combination with propidium monoazide treatment
Popis výsledku v původním jazyce
We have evaluated a promising technology combining sample treatment with propidium monoazide (PMA) prior to DNA extraction for selective detection of cells with intact cell membranes with detection of sequence element F57 by quantitative PCR (F57 qPCR).Element F57 is unique for MAP and is not known to exist in any other bacterial species. Conditions of PMA treatment were optimised for MAP isolate 7082 using live and heat-killed cells and comparing different DNA extraction procedures. The subsequent successful application of the optimised protocol to four other MAP isolates of different origins suggested that the optimised protocol might be broadly applicable to different MAP strains. Furthermore, different equations were compared to use the data resulting from this technology to optimally predict the percentage of live MAP cells in mixtures containing both live and dead cells.
Název v anglickém jazyce
Mycobacterium avium subsp paratuberculosis viability determination using F57 quantitative PCR in combination with propidium monoazide treatment
Popis výsledku anglicky
We have evaluated a promising technology combining sample treatment with propidium monoazide (PMA) prior to DNA extraction for selective detection of cells with intact cell membranes with detection of sequence element F57 by quantitative PCR (F57 qPCR).Element F57 is unique for MAP and is not known to exist in any other bacterial species. Conditions of PMA treatment were optimised for MAP isolate 7082 using live and heat-killed cells and comparing different DNA extraction procedures. The subsequent successful application of the optimised protocol to four other MAP isolates of different origins suggested that the optimised protocol might be broadly applicable to different MAP strains. Furthermore, different equations were compared to use the data resulting from this technology to optimally predict the percentage of live MAP cells in mixtures containing both live and dead cells.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Food Microbiology
ISSN
0168-1605
e-ISSN
—
Svazek periodika
141
Číslo periodika v rámci svazku
Suppl 1
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000281830700010
EID výsledku v databázi Scopus
—