Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

A novel satellite DNA sequence in the Peromyscus genome (PMSat): Evolution via copy number fluctuation

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F15%3A%230001325" target="_blank" >RIV/00027162:_____/15:#0001325 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.journals.elsevier.com/molecular-phylogenetics-and-evolution" target="_blank" >http://www.journals.elsevier.com/molecular-phylogenetics-and-evolution</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ympev.2015.06.008" target="_blank" >10.1016/j.ympev.2015.06.008</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    A novel satellite DNA sequence in the Peromyscus genome (PMSat): Evolution via copy number fluctuation

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Satellite DNAs (satDNA) are tandemly arrayed repeated sequences largely present in eukaryotic genomes, which play important roles in genome evolution and function, and therefore, their analysis is vital. Here, we describe the isolation of a novel satellite DNA family (PMSat) from the rodent Peromyscus eremicus (Cricetidae, Rodentia), which is located in pericentromeric regions and exhibits a typical satellite DNA genome organization. Orthologous PMSat sequences were isolated and characterized from threespecies belonging to Cricetidae: Cricetus cricetus, Phodopus sungorus and Microtus arvalis. In these species, PMSat is highly conserved, with the absence of fixed species-specific mutations. Strikingly, different numbers of copies of this sequence werefound among the species, suggesting evolution by copy number fluctuation. Repeat units of PMSat were also found in the Peromyscus maniculatus bairdii BioProject, but our results suggest that these repeat units are from genome regions outs

  • Název v anglickém jazyce

    A novel satellite DNA sequence in the Peromyscus genome (PMSat): Evolution via copy number fluctuation

  • Popis výsledku anglicky

    Satellite DNAs (satDNA) are tandemly arrayed repeated sequences largely present in eukaryotic genomes, which play important roles in genome evolution and function, and therefore, their analysis is vital. Here, we describe the isolation of a novel satellite DNA family (PMSat) from the rodent Peromyscus eremicus (Cricetidae, Rodentia), which is located in pericentromeric regions and exhibits a typical satellite DNA genome organization. Orthologous PMSat sequences were isolated and characterized from threespecies belonging to Cricetidae: Cricetus cricetus, Phodopus sungorus and Microtus arvalis. In these species, PMSat is highly conserved, with the absence of fixed species-specific mutations. Strikingly, different numbers of copies of this sequence werefound among the species, suggesting evolution by copy number fluctuation. Repeat units of PMSat were also found in the Peromyscus maniculatus bairdii BioProject, but our results suggest that these repeat units are from genome regions outs

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0068" target="_blank" >ED1.1.00/02.0068: CEITEC - central european institute of technology</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Molecular Phylogenetics and Evolution

  • ISSN

    1055-7903

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    92

  • Číslo periodika v rámci svazku

    Nov

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    193-203

  • Kód UT WoS článku

    000362381700017

  • EID výsledku v databázi Scopus