Genetic and phylogenetic characterization of novel bocaparvovirus infecting chimpanzee

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F16%3AN0000024" target="_blank" >RIV/00027162:_____/16:N0000024 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60077344:_____/16:00461839 RIV/60076658:12310/16:43890975 RIV/62157124:16170/16:43874335

Výsledek na webu

<a href="http://www.journals.elsevier.com/infection-genetics-and-evolution/" target="_blank" >http://www.journals.elsevier.com/infection-genetics-and-evolution/</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2015.11.013" target="_blank" >10.1016/j.meegid.2015.11.013</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Genetic and phylogenetic characterization of novel bocaparvovirus infecting chimpanzee

Popis výsledku v původním jazyce

Primate bocaparvoviruses were first described in 2005, since then further human and gorilla bocaparvoviruses have been identified. To uncover diversity of non-human primates' bocaparvoviruses, their phylogenetic relationship and potential to cross the host species barrier, we tested 153 fecal samples from 17 captive primate species. The only one captive female of central chimpanzee (coded CPZh2) has been identified as bocaparvovirus positive. Based on the full genome phylogenetic analyses, CPZh2 strain shows close relationship to HBoV3 and GBoV. Further recombination analysis confirmed expected mosaic origin of CPZh2 strain. According the phylogenetic position, following the ICTV recommendations, we propose a novel genotype within the Primate bocaparvovirus 1 species infecting chimpanzee.

Název v anglickém jazyce

Genetic and phylogenetic characterization of novel bocaparvovirus infecting chimpanzee

Popis výsledku anglicky

Primate bocaparvoviruses were first described in 2005, since then further human and gorilla bocaparvoviruses have been identified. To uncover diversity of non-human primates' bocaparvoviruses, their phylogenetic relationship and potential to cross the host species barrier, we tested 153 fecal samples from 17 captive primate species. The only one captive female of central chimpanzee (coded CPZh2) has been identified as bocaparvovirus positive. Based on the full genome phylogenetic analyses, CPZh2 strain shows close relationship to HBoV3 and GBoV. Further recombination analysis confirmed expected mosaic origin of CPZh2 strain. According the phylogenetic position, following the ICTV recommendations, we propose a novel genotype within the Primate bocaparvovirus 1 species infecting chimpanzee.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

INFECTION GENETICS AND EVOLUTION

ISSN

1567-1348

e-ISSN

—

Svazek periodika

37

Číslo periodika v rámci svazku

JAN

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

231-236

Kód UT WoS článku

000327701200017

EID výsledku v databázi Scopus

—