Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

W-enriched satellite sequence in the Indian meal moth, Plodia interpunctella (Lepidoptera, Pyralidae)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F17%3AN0000115" target="_blank" >RIV/00027162:_____/17:N0000115 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60077344:_____/17:00476738 RIV/60076658:12310/17:43895685

  • Výsledek na webu

    <a href="https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-017-9558-8" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-017-9558-8</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s10577-017-9558-8" target="_blank" >10.1007/s10577-017-9558-8</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    W-enriched satellite sequence in the Indian meal moth, Plodia interpunctella (Lepidoptera, Pyralidae)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The W chromosome of most lepidopteran species represents the largest heterochromatin entity in the female genome. Although satellite DNA is a typical component of constitutive heterochromatin, there are only a few known satellite DNAs (satDNAs) located on the W chromosome in moths and butterflies. In this study, we isolated and characterized new satDNA (PiSAT1) from microdissected W chromosomes of the Indian meal moth, Plodia interpunctella. Even though the PiSAT1 is mainly localized near the female-specific segment of the W chromosome, short arrays of this satDNA also occur on autosomes and/or the Z chromosome. Probably due to the predominant location in the non-recombining part of the genome, PiSAT1 exhibits a relatively large nucleotide variability in its monomers. However, at least a part of all predicted functional motifs is located in conserved regions. Moreover, we detected polyadenylated transcripts of PiSAT1 in all developmental stages and in both sexes (female and male larvae, pupae and adults). Our results suggest a potential structural and functional role of PiSAT1 in the P. interpunctella genome, which is consistent with accumulating evidence for the important role of satDNAs in eukaryotic genomes.

  • Název v anglickém jazyce

    W-enriched satellite sequence in the Indian meal moth, Plodia interpunctella (Lepidoptera, Pyralidae)

  • Popis výsledku anglicky

    The W chromosome of most lepidopteran species represents the largest heterochromatin entity in the female genome. Although satellite DNA is a typical component of constitutive heterochromatin, there are only a few known satellite DNAs (satDNAs) located on the W chromosome in moths and butterflies. In this study, we isolated and characterized new satDNA (PiSAT1) from microdissected W chromosomes of the Indian meal moth, Plodia interpunctella. Even though the PiSAT1 is mainly localized near the female-specific segment of the W chromosome, short arrays of this satDNA also occur on autosomes and/or the Z chromosome. Probably due to the predominant location in the non-recombining part of the genome, PiSAT1 exhibits a relatively large nucleotide variability in its monomers. However, at least a part of all predicted functional motifs is located in conserved regions. Moreover, we detected polyadenylated transcripts of PiSAT1 in all developmental stages and in both sexes (female and male larvae, pupae and adults). Our results suggest a potential structural and functional role of PiSAT1 in the P. interpunctella genome, which is consistent with accumulating evidence for the important role of satDNAs in eukaryotic genomes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Chromosome Research

  • ISSN

    0967-3849

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    25

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3-4

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    241-252

  • Kód UT WoS článku

    000414147500004

  • EID výsledku v databázi Scopus